TypeError:强制转换为Unicode:需要字符串或缓冲区

Question

此代码返回以下错误消息:

• open(infile,mode ='r',buffering = -1)为in_f,open(outfile,mode ='w',buffering = -1)为out_f:TypeError:强制转换为Unicode:需要字符串或缓冲区,找到文件

  # Opens each file to read/modify
  infile=open('110331_HS1A_1_rtTA.result','r')
  outfile=open('2.txt','w')
  
  import re
  
  with open (infile, mode='r', buffering=-1) as in_f, open (outfile, mode='w', buffering=-1) as out_f:
      f = (i for i in in_f if i.rstrip())
      for line in f:
          _, k = line.split('\t',1)
          x = re.findall(r'^1..100\t([+-])chr(\d+):(\d+)\.\.(\d+).+$',k)
          if not x:
              continue
          out_f.write(' '.join(x[0]) + '\n')
  

请有人帮助我.

Answer 1

你试图打开每个文件两次!首先你做:

infile=open('110331_HS1A_1_rtTA.result','r')

然后再次传递infile(这是一个文件对象)到open函数:

with open (infile, mode='r', buffering=-1)

open 当然希望它的第一个参数是文件名,而不是打开的文件!

只打开一次文件,你应该没问题.

Answer 2

对于不太具体的情况(不仅仅是问题中的代码 - 因为这是Google针对此一般性错误消息的第一个结果之一.运行某些带有None参数的os命令时也会发生此错误.

例如:

os.path.exists(arg)  
os.stat(arg)

当arg为None时,将引发此异常.

Answer 3

您正在尝试将文件对象作为文件名传递.尝试使用

infile = '110331_HS1A_1_rtTA.result'
outfile = '2.txt'

在代码的顶部.

(不仅的一倍,使用open()原因,试图再次打开该文件的问题,这也意味着infile和outfile执行过程中是从来不关,但一旦程序结束,他们可能会得到关闭.)