使用 mpirun 时如何使分析器（valgrind、perf、pprof）拾取/使用带有调试符号的本地版本库？

Question

编辑： 添加了重要说明，它是关于调试 MPI 应用程序的

系统安装的共享库没有调试符号：

$ readelf -S /usr/lib64/libfftw3.so | grep debug
$

因此，我在我的主目录中编译并安装了我自己的版本，并启用了调试（--with-debug CFLAGS=-g）：

$ $ readelf -S ~/lib64/libfftw3.so | grep debug
  [26] .debug_aranges    PROGBITS         0000000000000000  001d3902
  [27] .debug_pubnames   PROGBITS         0000000000000000  001d8552
  [28] .debug_info       PROGBITS         0000000000000000  001ddebd
  [29] .debug_abbrev     PROGBITS         0000000000000000  003e221c
  [30] .debug_line       PROGBITS         0000000000000000  00414306
  [31] .debug_str        PROGBITS         0000000000000000  0044aa23
  [32] .debug_loc        PROGBITS         0000000000000000  004514de
  [33] .debug_ranges     PROGBITS         0000000000000000  0046bc82

我已将 LD_LIBRARY_PATH 和 LD_RUN_PATH 设置为~/lib64首先包含，并ldd program确认应使用本地版本的库：

$ ldd a.out | grep fftw
        libfftw3.so.3 => /home/narebski/lib64/libfftw3.so.3 (0x00007f2ed9a98000)

该程序是使用MPI（消息传递接口）的并行数值应用程序。因此，要运行此应用程序，必须使用包装器（例如）。我使用 OpenMPI 实现。mpirunmpirun -np 1 valgrind --tool=callgrind ./a.out

尽管如此，各种分析器：Valgrind中的callgrind工具、CPU 分析google-perfutils和perf都找不到这些调试符号，从而导致或多或少无用的输出：

• 卡尔研磨：

  $ callgrind_annotate --include=~/prog/src --inclusive=no  --tree=none
  [...]
  --------------------------------------------------------------------------------
              Ir  file:function
  --------------------------------------------------------------------------------
  32,765,904,336  ???:0x000000000014e500 [/usr/lib64/libfftw3.so.3.2.4]
  31,342,886,912  /home/narebski/prog/src/nonlinearity.F90:__nonlinearity_MOD_calc_nonlinearity_kxky [/home/narebski/prog/bin/a.out]
  30,288,261,120  /home/narebski/gene11/src/axpy.F90:__axpy_MOD_axpy_ij [/home/narebski/prog/bin/a.out]
  23,429,390,736  ???:0x00000000000fc5e0 [/usr/lib64/libfftw3.so.3.2.4]
  17,851,018,186  ???:0x00000000000fdb80 [/usr/lib64/libmpi.so.1.0.1]
  

• 谷歌性能工具：

  $ pprof --text a.out prog.prof
  Total: 8401 samples
       842  10.0%  10.0%      842  10.0% 00007f200522d5f0
       619   7.4%  17.4%     5025  59.8% calc_nonlinearity_kxky
       517   6.2%  23.5%      517   6.2% axpy_ij
       427   5.1%  28.6%     3156  37.6% nl_to_direct_xy
       307   3.7%  32.3%     1234  14.7% nl_to_fourier_xy_1d
  

• 性能事件：

  $ perf report --sort comm,dso,symbol
  # Events: 80K cycles
  #
  # Overhead  Command         Shared Object                                        Symbol
  # ........  .......  ....................  ............................................
  #
      32.42%  a.out     libfftw3.so.3.2.4     [.]            fdc4c
      16.25%  a.out             7fddcd97bb22  [.]     7fddcd97bb22
       7.51%  a.out     libatlas.so.0.0.0     [.] ATL_dcopy_xp1yp1aXbX
       6.98%  a.out     a.out                 [.] __nonlinearity_MOD_calc_nonlinearity_kxky
       5.82%  a.out     a.out                 [.] __axpy_MOD_axpy_ij
  

---

编辑 添加于 11-07-2011：
我不知道这是否重要，但是：

$ file /usr/lib64/libfftw3.so.3.2.4
/usr/lib64/libfftw3.so.3.2.4: ELF 64-bit LSB shared object, x86-64, version 1 (SYSV), dynamically linked, stripped

和

$ file ~/lib64/libfftw3.so.3.2.4
/home/narebski/lib64/libfftw3.so.3.2.4: ELF 64-bit LSB shared object, x86-64, version 1 (GNU/Linux), dynamically linked, not stripped

Answer 1

最近的分析工具通常处理这种情况的方式是查阅外部的、匹配的库的未剥离版本。

在基于 debian 的 Linux 发行版上，这通常是通过安装-dbg软件包的后缀版本来完成的；在基于 Redhat 的系统上，它们被命名为-debuginfo.

对于您上面提到的工具；如果调试信息包已安装在标准位置，他们通常会正常工作（tm）并找到库的调试符号。