从矩阵中删除0的所有列

Question

我有一个带15000列的矩阵.有些细胞float有价值,有许多有0.我想完全删除所有值都在的所有列0.

     col1     col2     col3     col4
row1  1        0        0        1
row2  3.4      0        0        2.4
row3  0.56     0        0        0
row4  0        0        0        0

我想删除列col2,col3并保留其余部分.我怎么能用R做呢？谢谢

Answer 1

一个更快的方法来做同样的事情(快3到5倍)

M[,colSums(M^2) !=0]

编辑:添加了此处建议的各种方法的时序详细信息.@Dwin使用的方法M[, colSums(abs(M)) ! == 0]似乎工作得最快,特别是当矩阵很大时.如果建议采用其他解决方案,我会更新基准测试报告.

m <- cbind(rnorm(1000),0)
M <- matrix(rep(m,7500), ncol=15000)

f_joran   = function(M) M[, !apply(M==0,2,all)]
f_ramnath = function(M) M[, colSums(M^2) != 0]
f_ben     = function(M) M[, colSums(M==0) != ncol(M)]
f_dwin    = function(M) M[, colSums(abs(M)) != 0]

library(rbenchmark)
benchmark(f_joran(M), f_ramnath(M), f_ben(M), f_dwin(M), 
   columns = c('test', 'elapsed', 'relative'), 
   order = 'relative', replications = 10)


          test elapsed relative
4    f_dwin(M)  11.699 1.000000
2 f_ramnath(M)  12.056 1.030515
1   f_joran(M)  26.453 2.261133
3     f_ben(M)  28.981 2.477220

Answer 2

怎么样,使用apply和all:

M <- as.matrix(data.frame(a=runif(10),b=rep(0,10),c=runif(10),d=rep(0,10)))

M[,which(!apply(M,2,FUN = function(x){all(x == 0)}))]