如何在Julia中使用Anaconda中没有的需要通过pip安装的Python包

Question

我使用 Julia 1.6.0（截至今天的测试版）并希望plfit通过PyCall.

不幸的是，plfit在 Anaconda 中不可用，因此我无法使用 Conda 模块安装它：

julia> using Conda

julia> Conda.add("plfit")
[ Info: Running `conda install -y plfit` in root environment
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.

PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:

  - plfit

...

我如何从 Julia 安装这个包？

Answer 1

您可以pip通过PyCall模块从 Julia运行。

此外，该包plfit引用了cythonPython 内置的 Julia 中不存在的包，并且不会自动安装。因此你需要做：

using PyCall
run(`$(PyCall.python) -m pip install --upgrade cython`)
run(`$(PyCall.python) -m pip install plfit`)

现在plfit可以从 Julia 使用该软件包：

julia> plfit = pyimport("plfit");

julia> x=rand(1000);

julia> myplfit = plfit.plfit(x)
PYTHON plfit executed in 0.064029 seconds
xmin: 0.397582 n(>xmin): 625 alpha: 2.92546 +/- 0.0770183   Log-Likelihood: 36.3511   ks: 0.197384 p(ks): 4.09676e-22
PyObject <plfit.plfit.plfit object at 0x0000000064871A90>

最后，请注意，有时以这种方式安装的某些软件包可能会在查找二进制 Python 依赖项时遇到问题（plfit 则不是这种情况）。在这种情况下，您需要将该文件夹添加%HOMEPATH%\.julia\conda\3\Library\bin到您的PATH环境变量中（根据您的配置和平台替换%HOMEPATH%\.julia为JULIA_DEPOT_PATH或适当的系统路径）。