是否值得使用inline :: C来加速数学运算

Question

我一直在研究处理大量dna的perl程序.它输出然而究竟是什么,我需要花费更长的时间比我想用我NYTprof已经收窄主要问题领域是,增加了我的价值观一起循环.会使用inline :: C进行数学计算,使我的程序更快,还是应该接受速度并继续前进？还有另一种提高速度的方法吗？这是我的程序和它将运行的输入以及已经输入的默认值的可执行文件.

Answer 1

您不太可能在这里获得有用的帮助（包括）。我可以看到您的代码存在各种问题，但与语言的选择无关。

1. 使用 CPAN。如果您正在解析 genbank，请使用一些适当的模块。

2. 您正在用 Perl 编写汇编，而 Perl 和您都不太擅长这一点。当您不向子例程传递参数而是依赖全局变量时，几乎不可能知道发生了什么。什么@X1, @X2, @Y1, @Y2意思？

3. 以下可能是您的问题：（until ($ender - $starter > $tlength) {第 153 行）。根据您的测试用例，这些值从 103、1 和 200 开始，并且不清楚它们何时或是否会改变。根据 中的内容@te，它可能会也可能不会脱离循环；我只是无法从你的代码中看出。

4. 如果我们准确地知道 的参数add、输入输出不变量以及它返回的内容，将会有所帮助。

这就是我得到的。