关于将shell命令插入到python中

Question

我已经在python脚本中插入了一些shell命令,如下所示:

#!/usr/bin/python

import os,sys,re
import gzip
import commands

path = "/home/x/nearline"

for file in os.listdir(path):
  if re.match('.*\.recal.fastq.gz', file):
    fullpath = os.path.join(path, file)
    result = commands.getoutput('zcat fullpath |wc -l')
    numseqs = int(result)/4.0
  print numseqs

zcat fullpath |wc -l 是插入的shell命令.

问题是,我fullpath在这里为所有fastq文件定义,但在被放入之后' ',似乎这fullpath不起作用.我怎么解决这个问题？

Answer 1

您必须将字符串与变量的值连接:

result = commands.getoutput('zcat ' + fullpath + ' |wc -l')