使用 awk 重新格式化文本文件并将其剪切为单行

Question

数据：

CHR SNP BP A1 TEST NMISS BETA SE L95 U95 STAT P 
1   chr1:1243:A:T 1243 T ADD 16283 -6.124 0.543 -1.431 0.3534 -1.123 0.14

期望的输出：

MarkerName P-Value 
  chr1:1243  0.14

实际文件是 1.2G 的行，如上

我需要将文本的第二列去掉第二个冒号，然后将其粘贴到最后的第 12 列并为其指定一个新标题。

我试过了：

awk '{print $2, $12}' | cut -d: -f1-2

但这会删除冒号后的整行，我想保留“p”列

我将其输出到一个新文件，然后使用 awk 将其粘贴到 P 值列上，但想知道是否有一种单行方法可以做到这一点？

非常感谢

Answer 1

我以更容易理解的形式发表评论：

$ awk '
BEGIN {
    print "MarkerName P-Value"          # output header
}
NR>1 {                                  # skip the funky first record
    split($2,a,/:/)                     # split by :
    printf "%s:%s %s\n",a[1],a[2],$12   # printf allows easier output formating
}' file

输出：

MarkerName P-Value
chr1:1243 0.14