6 python linux pycharm survival-analysis
我正在尝试在linux中的python(pycharm)中运行生存分析,这是代码的一部分
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
#matplotlib inline
import pandas as pd
from sklearn.impute import SimpleImputer
from sklearn.pipeline import make_pipeline
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sksurv.datasets import load_flchain
from sksurv.linear_model import CoxPHSurvivalAnalysis
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我收到错误“ModuleNotFoundError:没有名为“sksurv”的模块”,我尝试了所有方法,但没有任何效果。
所需的依赖项scikit-survival
,
cvxpy
cvxopt
joblib
numexpr
numpy
1.12或更高版本
osqp
pandas
0.21或更高版本
scikit-learn
0.22
scipy
1.0或更高版本
...将在pip
您运行时自动安装:
pip install scikit-survival
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
然而,特别是一个模块,osqp
将CMake作为其依赖项之一。如果你没有安装CMake,pip install scikit-survival
将会抛出一个错误并且安装将会失败。
您可以在cmake.org/download下载适合您操作系统的 CMake
CMake安装完成后,你应该能够成功运行
pip install scikit-survival
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
笔记: