有关 x64 的 .o 文件的信息不可用：使用 Rcpp 检查 R 包的注意事项

Question

我使用Windows和刚刚更新到R 4.0.3（带RStudio至1.3.959），然后跑掉了R检查使用我的包之一Rcpp，并RcppArmadillo和我得到了以下注释：

> checking compiled code ... NOTE
  Note: information on .o files for i386 is not available
  Note: information on .o files for x64 is not available
  File 'C:/Users/NIR_Workstation/Documents/GitHub/prospectr.Rcheck/prospectr/libs/i386/prospectr.dll':
    Found 'abort', possibly from 'abort' (C), 'runtime' (Fortran)
    Found 'exit', possibly from 'exit' (C), 'stop' (Fortran)
    Found 'printf', possibly from 'printf' (C)
  File 'C:/Users/NIR_Workstation/Documents/GitHub/prospectr.Rcheck/prospectr/libs/x64/prospectr.dll':
    Found 'abort', possibly from 'abort' (C), 'runtime' (Fortran)
    Found 'exit', possibly from 'exit' (C), 'stop' (Fortran)
    Found 'printf', possibly from 'printf' (C)

当我在R 4.0.2. 我试图找出我的包裹里发生了什么，但没有成功。

我也试过这个（与R 4.0.3）：

Rcpp::Rcpp.package.skeleton("aTest", example_code = TRUE)

rcmdcheck::rcmdcheck(error_on = "warning", check_dir = "check")

我得到了与我的包的一个输出相同类型的 NOTE。再次R 4.0.2为此注意不输出。

对这个注意事项有什么想法吗？或者至少对我可以尝试找出发生了什么的事情有任何建议？

提前致谢。

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更新的问题：

我想在更新我的问题之前进行额外的测试。

他们来了：

我R 4.0.3在其他几台 Windows 机器上进行了全新安装rtools，RStudio以及devtools运行下面示例所需的包（没有预编译的对象）。我设法用来 reprex()重现我为另一个使用Rcpp.package.skeleton()以下创建的模板包获得的注意：

> checking compiled code ... NOTE
  Note: information on .o files for i386 is not available
  Note: information on .o files for x64 is not available
  File 'C:/Users/NIR_Workstation/Documents/GitHub/prospectr.Rcheck/prospectr/libs/i386/prospectr.dll':
    Found 'abort', possibly from 'abort' (C), 'runtime' (Fortran)
    Found 'exit', possibly from 'exit' (C), 'stop' (Fortran)
    Found 'printf', possibly from 'printf' (C)
  File 'C:/Users/NIR_Workstation/Documents/GitHub/prospectr.Rcheck/prospectr/libs/x64/prospectr.dll':
    Found 'abort', possibly from 'abort' (C), 'runtime' (Fortran)
    Found 'exit', possibly from 'exit' (C), 'stop' (Fortran)
    Found 'printf', possibly from 'printf' (C)

^{由reprex 包(v0.3.0)于 2020 年 10 月 18 日创建}

Rcpp::Rcpp.package.skeleton("aTest", example_code = TRUE)

rcmdcheck::rcmdcheck(error_on = "warning", check_dir = "check")

除了上述测试之外，我还运行了相同的代码：

• R 4.0.3 和 rtools35

• R 4.0.2 和 rtools40

• R 4.0.3在 linux ( x86_64-pc-linux-gnu (64-bit))

对于这三个测试，检查完全通过。

总之，问题只出现在R 4.0.3with rtools40。假设问题来自 是否正确rtools40？如果是，对 CRAN 检查/提交有何影响？

谢谢

Answer 1

在过去的几个月里，我一直有同样的问题。几个月前，我在 Windows 的 R-devel 中注意到了同样的问题（中止的误报等）。

该问题并非特定于 Rcpp。我可以为仅包含 Fortran、仅包含 C 或仅包含 C++ 的包重现注释。我在 Windows 命令提示符下使用 Rtools40 和 R 4.0.3 在 PATH 中运行 R CMD。NOTE 目前出现在 Bioconductor 3.12 检查数百个包中，似乎是包含任何 Fortran、C 或 C++ 源代码的任何包。正如您所指出的，NOTE 仅在 Windows、R 4.0.3 或更高版本和 Rtools40 中出现。对于 Linux 或 Mac 下的相同软件包或旧版本的 R，不会出现 NOTE 。

两天前我向 CRAN 提交了一个包，但 CRAN 没有将 NOTE 识别为问题，即使我在同一个包上运行 R CMD 检查时看到了 NOTE。所以我不认为它会导致你提交 CRAN 的问题。