如何使用pygraphviz增加点图中节点之间的间距？

Question

我在尝试增加我正在制作的分层图中的节点之间的间距时遇到了麻烦。我希望在该图上放置标签，因此节点之间的间距必须相当大，但我不确定 pygraphvis_layout 的“args”参数如何工作，或者我是否正确使用它。

似乎相同等级的节点之间的间距应该至少为 2 英寸，但这并没有反映在实际图像中。据我测试，改变提供给 nodeep 的数字对间距没有影响。

我已经查看了其他解决方案：pydot 没有工作，似乎输出了我无法打开的 png 文件，而且我已经在使用 NetworkX 来绘制其他相关的图形。

（除了指定的导入之外，复制还需要 graphviz。）

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
from networkx.drawing.nx_agraph import pygraphviz_layout

plt.figure(figsize=(10, 7))
graph = nx.DiGraph([(0, 1), (0, 2),
                    (1, 3), (1,4), (2,5), (2,6),
                    (3, 7), (3, 8), (4, 9), (4, 10), (5, 11), (5, 12), (6, 13), (6, 14)])
pos = pygraphviz_layout(graph, prog="dot", args='-Gnodesep=2')
nx.draw_networkx_nodes(
    graph, pos, nodelist=graph.nodes, node_size=1000, node_color="r", alpha=0.8
)
nx.draw_networkx_edges(graph, pos, edgelist=graph.edges, width=1, edge_color="k")
plt.axis("off")
plt.savefig("test.svg")
plt.show()

Answer 1

绘制图形的空间受到图形尺寸的限制。尝试调整大小，例如：

pos = pygraphviz_layout(graph, prog="dot", args='-Gnodesep=2')
nx.draw_networkx_nodes(...)
nx.draw_networkx_edges(...)
plt.figure(figsize=(20,20))
plt.show()

一旦尺寸足够大，Gnodesep论证就应该有效。