是否可以从现有版本的 r 创建 r conda 环境？

Question

很久以前，我的计算机上安装了 R 3.6，它具有我通常使用的所有软件包。我想使用这个版本的 R 制作一个 jupyter 笔记本，但是我的 R conda 环境是一个不同的 r 版本并且没有我的典型包。有没有办法从我的非 conda 版本的 R 创建一个新的 R conda 环境？和/或，还有一种方法可以使用我喜欢的非 conda 版本的 R 作为 Jupyter Notebooks 的内核吗？

Answer 1

不，非 Conda 版本的 R 不能用作 Conda 环境的基础。

但是，无论安装在何处，都可以将任何 R 安装用作 Jupyter 中的内核。这样做的关键是在 R 环境中安装 IRkernel 包。

将 R 注册为 Jupyter 内核的步骤

0. 如果 Jupyter 安装在 Conda 环境中，例如my_jupyter_env，首先激活该环境：

   $ conda activate my_jupyter_env
   (my_jupyter_env) $ 
   

   否则，即jupyter是 on PATH，然后在没有激活任何 Conda 环境的情况下继续。

1. 使用本机 R 启动 R 会话：

   (my_jypyter_env) $ path/to/native/R
   

2. 安装IRkernel：

   > install.packages("IRkernel")
   

   请注意，如果此 R 在 Conda 环境中，请conda install r-irkernel在 R 会话之外使用。

3. 在 R 会话中，将 R 注册为内核。例如，如果我本地安装了 R 3.6.0，我可能会称它为：

   > IRkernel::installspec(name="ir36_native", displayname="R 3.6.0 (native)")
   

   但参数是你想要的。

4. 退出会话并启动 Jupyter。

   > q()
   (my_jupyter_env) $ jupyter notebook
   

5. 使用“新建”按钮创建一个新笔记本并从下拉列表中选择 R 内核。