使用 Networkx 可视化大图

Question

我有一个节点1、节点2 形式的数据集，想要使用网络来构建图表。这是一个相当大的数据集，导致图具有 500k 个节点

import pandas as pd
import numpy as np
import networkx as nx

df = pd.read_csv('large.csv')
G=nx.from_pandas_edgelist(df, 'node1','node2')

这部分代码运行速度非常快，将数据帧转换为图形。然后我尝试应用弹簧布局：

pos = nx.spring_layout(G)

这部分代码需要很长时间。如果我尝试不同的布局，如circular_layout或shell_layout，它会非常快，但布局与我的图表相符。

对于这么大的图，有没有更好的方法来应用 spring_layout ？

Answer 1

对于那么大的图，我不建议用于networkx此类大图的可视化。替代方案是graphviz或Gephi。查看以下相关问题列表：

• 海量图表可视化
• 可视化大图
• 可视化对于 GraphViz 来说太大的无向图？
• 用于可视化非常大的图形的软件
• 如何可视化大图？