使用BoostC 语言开发一个小的 Rcpp 包和它的一些几何函数。
完成了函数的编写,一切运行良好。Clean and Rebuild最后一次测试一切正常(并测试功能),然后再推送到 GitHub。一旦我仔细检查了该目录是否全部干净地存储在 GitHub 中,我就从本地计算机中删除了该目录。还应该注意的是,我有 Roxygen2 在此运行并管理NAMESPACE文件。
克隆回目录后,Clean and Rebuild出现以下错误:
==> Rcpp::compileAttributes()
* Updated R/RcppExports.R
==> R CMD INSTALL --preclean --no-multiarch --with-keep.source MinimumRcpp
* installing to library ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library’
* installing *source* package ‘MinimumRcpp’ ...
clang++ -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/Rcpp/include" -I/usr/local/include -fPIC -Wall -g -O2 -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
** libs
clang++ -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/Rcpp/include" -I/usr/local/include -fPIC -Wall -g -O2 -c findParetoSet.cpp -o findParetoSet.o
clang++ -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/Rcpp/include" -I/usr/local/include -fPIC -Wall -g -O2 -c kintersection.cpp -o kintersection.o
clang++ -std=gnu++11 -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o MinimumRcpp.so RcppExports.o findParetoSet.o kintersection.o -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation
installing to /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/MinimumRcpp/libs
** R
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Error in asNamespace(ns) : not a namespace
Error : unable to load R code in package ‘MinimumRcpp’
ERROR: lazy loading failed for package ‘MinimumRcpp’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/MinimumRcpp’
Exited with status 1.
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
当然,代码中没有任何变化。但是,我确实有以下.gitignore文件:
# /.gitignore
inst/lib
.Rproj.user ## Could this be an issue?
.Rproj.user/ ## Could this be an issue?
.Rproj.user/** ## Could this be an issue?
src/*.o
src/*.so
src/*.dll
src/symbols.rds
.Rhistory
.RData
.DS_Store
## QtCreator
Rcpp.pro
Rcpp.pro.user
*.autosave
.#*
*.tar.gz
vignettes/*_cache
## GNU global
GPATH
GRTAGS
GTAGS
##
local/
## docker helpers
docker/*sh
docker/*/*.sh
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
# /.Rbuildignore
debian
inst/doc/html
inst/doc/latex
inst/doc/man
inst/doc/jss.bst
vignettes/jss.bst
^.*\.Rproj$
^\.Rproj\.user$
vignettes/notyet
doxyfile
\.travis\.yml
\.dir-locals\.el
\.clang_format
vignettes/getCurrentVersionsOfCitedPackages.R
^Contributing.md$
^\.codecov\.yml$
inst/include/Rcpp.h.new
inst/include/Rcpp.h.old
LICENSE
.*\.tar\.gz$
\.editorconfig
docker
^GPATH
^GRTAGS
^GTAGS
^local
vignettes/Makefile
vignettes/rmd
\.github
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
是否有可能是一些构建包所需的包数据被遗留下来并导致了当前的问题?
任何援助将不胜感激。此外,关于如何调试的任何建议都会有所帮助,因为当前的输出消息非常模糊,让我没有方向。
这是用于重现性的 GitHub 存储库:https : //github.com/eduardoRubioG/MinimumRcpp
菜鸟错误,但一个严重的错误:
永远永远保持脚本文件在R/目录
目录中的所有内容(我们的意思是所有内容)均已获取(前提是它看起来像 R 代码,_i.e. 以 结尾.R)
您library(MinimumRcpp)在那里留下了一个带有调用的脚本,所以现在您的包字节码编译想要自行获取源代码 --> 不是一个好的计划
简而言之,保留此类脚本,但将它们放入eg local/并local/通过.Rbuildignore.
加上重要的风格课
rm(list = ls(all = TRUE))在你的代码中所以,如果你这样做mv R/script.R R/script.R.txt并重建,一切都很好。
(我收到了六个警告,因为n不是一个size_t但与一个相比。你可能想更早地投射它。)
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