使用 dplyr 计算每个变量出现的次数

Question

这是我的数据框（tibble）df：

   ENSG00000000003 ENSG00000000005 ENSG00000000419 ENSG00000000457 ENSG00000000460
             <dbl>           <dbl>           <dbl>           <dbl>           <dbl>
 1              61               0              70               0               0
 2               0               0             127               0               0
 3             318               0               2               0               0
 4               1               0               0               0               0
 5               1               0              67               0               0
 6               0               0               0             139               0
 7               0               0               0               0               0
 8             113               0               0               0               0
 9               0               0               1               0               0
10               0               0               0               1               0

对于每个列/变量，我想计算值大于 10 的行数。在这种情况下，第 1 列将是 3，第 2 列将是 0，等等。这是一个测试数据框，我想对许多列执行此操作。

Answer 1

colSums我们可以在逻辑矩阵上使用

colSums(df > 10, na.rm = TRUE)

或者使用dplyr

library(dplyr)
df %>%
   summarise_all(~ sum(. > 10, na.rm = TRUE))