NetworkX 中的自我图

ank*_*kla 6 python graph bipartite networkx

我有带有节点的二部图,例如(a1,a2,...a100,m1,m2,...)。我想找到某些节点的诱导子图(a1,a2 和 a10)。我可以通过使用来做到这一点networkx.ego_graph,但它一次需要一个顶点并返回诱导图。我想知道是否有任何方法可以对我感兴趣的所有节点立即执行此操作,然后选择最大的节点。

yat*_*atu 5

对于一般情况,可以使用 获得自我图nx.ego_graph

尽管在您的特定情况下,您似乎想找到ego graph网络中最大的诱导。为此,您可以先找到度数最高的节点,然后获取其自我图。


让我们创建一个示例二部图:

import networkx as nx

B = nx.Graph()
B.add_nodes_from([1, 2, 3, 4, 5, 6], bipartite=0)
B.add_nodes_from(['a', 'b', 'c', 'j', 'k'], bipartite=1)
B.add_edges_from([(1, 'a'), (1, 'b'), (2, 'b'), (2, 'c'), (3, 'c'), (4, 'a'), 
                  (2, 'b'), (3, 'a'), (5, 'k'), (6, 'k'), (6, 'j')])


rcParams['figure.figsize'] = 12, 6
nx.draw(B, node_color='lightblue', 
        with_labels=True)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

在此处输入图片说明

正如问题中提到的,假设我们要在以下节点列表中进行选择:

l = [1,'a',6]
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

看起来您要选择其中具有最高中心度的一个。为此,您可以这样做:

deg_l = {i:B.degree(i) for i in l}    
highest_centrality_node = max(deg_l.items(), key=lambda x: x[1])[0]
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

现在我们可以绘制相应ego_graph的:

ego_g = nx.ego_graph(B, highest_centrality_node)
d = dict(ego_g.degree)
nx.draw(ego_g, node_color='lightblue', 
        with_labels=True, 
        nodelist=d, 
        node_size=[d[k]*300 for k in d])
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

在此处输入图片说明