Tha*_*uys 7 python sql git r dvc
我想对 ~1m+ 文档进行分类,并有一个版本控制系统用于相应模型的输入和输出。
数据随时间变化:
所以基本上“一切”可能会改变:观察量、特征和值。我们有兴趣在不使用 10/100+ GB 磁盘容量的情况下使 ml 模型构建可重现,因为我们保存了输入数据的所有更新版本。目前数据的卷大小是~700mb。
我发现的最有前途的工具是:https : //github.com/iterative/dvc。目前,数据存储在数据库中,从那里加载到 R/Python 中。
题:
使用 dvc 可以(非常近似)节省多少磁盘容量?
如果可以粗略估计一下。我试图找出是否只保存了数据的“差异”。我没有通过阅读以下内容找到太多信息:https : //github.com/iterative/dvc#how-dvc-works或其他文档。
我知道这是一个非常模糊的问题。它将高度依赖于数据集。但是,我仍然有兴趣获得一个非常近似的想法。
Shc*_*ein 10
让我尝试总结一下 DVC 如何存储数据,我希望您能够从中计算出在您的特定场景中将节省/消耗多少空间。
DVC 在单个文件级别存储和删除重复数据。那么,从实践的角度来看,这通常意味着什么。
我将用dvc add作为一个例子,但同样的逻辑也适用于保存数据文件或目录到DVC缓存中的所有命令- dvc add,dvc run等等。
假设我有一个 1GB 的 XML 文件。我开始用 DVC 跟踪它:
$ dvc add data.xml
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
在现代文件系统上(或者如果hardlinks,symlinks已启用,请参阅此处了解更多详细信息)执行此命令后我们仍然消耗 1GB(即使文件被移入 DVC 缓存并且仍然存在于工作区中)。
现在,让我们稍微更改一下并再次保存:
$ echo "<test/>" >> data.xml
$ dvc add data.xml
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
在这种情况下,我们将消耗 2GB。DVC 不会在同一文件的两个版本之间进行差异,也不会将文件拆分为块或块以了解只有一小部分数据发生了变化。
准确地说,它计算
md5每个文件并将其保存在内容可寻址的键值存储中。md5文件用作键(缓存中文件的路径),值是文件本身:Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)(.env) [ivan@ivan ~/Projects/test]$ md5 data.xml 0c12dce03223117e423606e92650192c (.env) [ivan@ivan ~/Projects/test]$ tree .dvc/cache .dvc/cache ??? 0c ??? 12dce03223117e423606e92650192c 1 directory, 1 file (.env) [ivan@ivan ~/Projects/test]$ ls -lh data.xml data.xml ----> .dvc/cache/0c/12dce03223117e423606e92650192c (some type of link)
现在让我们假设我们有一个images包含大量文件的1GB 大目录:
$ du -hs images
1GB
$ ls -l images | wc -l
1001
$ dvc add images
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
此时我们仍然消耗1GB。什么也没有变。但是如果我们通过添加更多文件(或删除其中一些)来修改目录:
$ cp /tmp/new-image.png images
$ ls -l images | wc -l
1002
$ dvc add images
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
在这种情况下,在保存新版本后我们仍然接近 1GB 的消耗。DVC 计算目录级别的差异。它不会保存目录中之前存在的所有文件。
同样的逻辑也适用于保存数据文件或目录到DVC缓存中的所有命令- dvc add,dvc run等等。
请让我知道它是否清楚,或者我们需要添加更多细节,澄清。
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