删除具有nan值的行

Question

比方说,我有这样的数据:

data <- c(1,2,3,4,5,6,NaN,5,9,NaN,23,9)
attr(data,"dim") <- c(6,2)
data

     [,1] [,2]
[1,]    1  NaN
[2,]    2    5
[3,]    3    9
[4,]    4  NaN
[5,]    5   23
[6,]    6    9

现在我想要删除其中包含NaN值的行:第1行和第4行.但我不知道这些行在哪里,如果它是100.000+行的数据集,所以我需要找到它们的函数并删除完整的一行.

任何人都能指出我正确的方向吗？

Answer 1

该函数complete.cases将告诉您所需的行位置:

data <- matrix(c(1,2,3,4,5,6,NaN,5,9,NaN,23,9), ncol=2)
data[complete.cases(data), ]

     [,1] [,2]
[1,]    2    5
[2,]    3    9
[3,]    5   23
[4,]    6    9

Answer 2

数据

data <- matrix(rnorm(100000000), ncol=10000)
idx <- sample(1:10000,100)
idy <- sample(1:10000,100)
data[idx,idy] <- NaN

功能

foo <- function(d=data) d[apply(d,2,function(x) any(is.nan(x))),]

运行时间

> system.time(data[complete.cases(data),])
   user  system elapsed 
   3.53    0.12    3.65 

> system.time(foo(data))
   user  system elapsed 
   2.37    0.09    2.46