需要使用仅 NA 数据创建 ggplot 热图，但收到“错误：必须从色调调色板中请求至少一种颜色。”

Question

我需要创建一行热图，偶尔会从仅 NA 列派生，但无论如何都必须显示。在下面的示例中，从 p2 列生成热图将呈现“错误：必须从色调调色板中请求至少一种颜色。”。有什么方法可以强制 ggplot 显示“空”热图？

library(ggplot2)
id <- letters[1:5]
p1 <- factor(c(1,NA,2,NA,3))
p2 <- factor(c(NA,NA,NA,NA,NA))
dat <- data.frame(id=id, p1=p1, p2=p2)

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + geom_tile(aes(fill = p1), colour = "white") #works fine

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + geom_tile(aes(fill = p2), colour = "white") #renders error

Answer 1

我想如果你明确地告诉ggplot如何NA使用na.value内部scale_fill_manual调用来处理值。这应该可以解决您的问题，或者至少让您朝着正确的方向前进：

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + 
  geom_tile(aes(fill = p2), colour = "white") + 
  scale_fill_manual(values = "white", 
                    na.value = "black") 

您可以更改values参数以更好地处理您喜欢的颜色