无法使用 dplyr 重命名列

Question

我正在尝试将数据框中的列从Characteristics..genotype.togenotype和 from Characteristics..age.to重命名为age：

pData(raw_data) %>%
  rename(
    age = Characteristics..age.,
    genotype = Characteristics..genotype.
  )

我收到以下错误：

重命名错误（.，年龄=特征..年龄.，基因型=特征..基因型.）：对象“特征..年龄”。未找到

这是没有意义的，因为数据框中存在列：

pData(raw_data)$Characteristics..genotype.

上面的输出：

[1] N171-HD82Q N171-HD82Q N171-HD82Q wt wt wt N171-HD82Q N171-HD82Q N171-HD82Q wt wt [12] wt N171-HD82Q N171-HD82Q
N171-HD82Q wt wt wt
级别：N171-HD82Q wt

我缺少什么？

Answer 1

一个选项是反引号

library(dplyr)
 pData(raw_data) %>%
  rename(
    age = `Characteristics..age.`,
   genotype = `Characteristics..genotype.`
  )   

或者根据错误（用 重现plyr::rename），最好使用::指定从中加载的包以避免屏蔽

pData(raw_data) %>%
  dplyr::rename(
    age = Characteristics..age.,
   genotype = Characteristics..genotype.
  )   

但是，在测试时dplyr_0.8.3，它工作得很好，没有反引号

data(mtcars)
raw_data <- head(mtcars)
names(raw_data)[1] <- "Characteristics..genotype."
raw_data %>%
      dplyr::rename(genotype = Characteristics..genotype.)
#             genotype cyl disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
# ...

问题是plyr还包含相同的rename功能，因此如果也加载了该包，它可能会掩盖dplyr::rename

raw_data %>% 
    plyr::rename(genotype = Characteristics..genotype.)

plyr::rename(., genotype = Characteristics..genotype.) 中的错误：
未使用参数（genotype = Characteristics..genotype.）