adi*_*rof 4 python windows scikit-learn python-multiprocessing python-pool
我正在尝试在Windows 10 Intel Core i7-8550U处理器上使用Python 3.7.4进行python多处理。
我正在用两个函数测试多进程,一个函数使用基本sleep(),另一个函数使用sklearn的matthews_corrcoef。多重处理可使用睡眠功能,但不能使用sklearn功能。
import numpy as np
from sklearn.metrics import matthews_corrcoef
import time
import concurrent.futures
from multiprocessing import Process, Pool
from functools import partial
import warnings
import sys
class Runner():
def sleeper(self, pred, man, thr = None):
return time.sleep(2)
def mcc_score(self, pred, man, thr = None):
warnings.filterwarnings("ignore")
return matthews_corrcoef(pred, man)
def pool(self, func):
t1 = time.perf_counter()
p = Pool()
meth = partial(func, pred, man)
res = p.map(meth, thres)
p.close()
t2 = time.perf_counter()
print(f'Pool {func.__name__} {round((t2-t1), 3)} seconds')
def vanilla(self, func):
t1 = time.perf_counter()
for t in thres:
func(pred, man)
t2 = time.perf_counter()
print(f'vanilla {func.__name__} {round((t2-t1), 3)} seconds')
if __name__== "__main__":
print(sys.version)
r = Runner()
thres = np.arange(0,1, 0.3)
print(f"Number of thresholds {len(thres)}")
pred = [1]*200000
man = [1]*200000
results = []
r.pool(r.mcc_score)
r.vanilla(r.mcc_score)
r.pool(r.sleeper)
r.vanilla(r.sleeper)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
在Windows中,对于mcc_score函数,使用pool实际上比普通版本慢,而在Linux中,它可以正常工作。
这是示例输出
#windows
3.7.4 (default, Aug 9 2019, 18:34:13) [MSC v.1915 64 bit (AMD64)]
Number of thresholds 4
Pool mcc_score 3.247 seconds
vanilla mcc_score 1.591 seconds
Pool sleeper 5.828 seconds
vanilla sleeper 8.001 seconds
#linux
3.7.0 (default, Jun 28 2018, 13:15:42) [GCC 7.2.0]
Number of thresholds 34
Pool mcc_score 1.946 seconds
vanilla mcc_score 8.817 seconds
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我阅读了stackoverflow中的文档和其他相关问题,其中主要说明了使用if __name__== "__main__":。非常感谢您的帮助,因为我已经坚持了很长时间。如果我错过任何重要信息,请提及,我会提供。
首先,我将简化您的代码。由于类中的方法从不使用类变量,因此我将跳过类方法而仅使用方法。
起点是多处理文档中的示例。要查看使用的好处Pool,我增加了两秒钟的睡眠时间并打印了一个时间戳记。
import datetime
from multiprocessing import Pool
import time
def fx(x):
time.sleep(2)
print(datetime.datetime.utcnow())
return x*x
if __name__ == '__main__':
with Pool() as p:
print(p.map(fx, range(10)))
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
输出符合预期
2019-11-10 11:10:05.346985
2019-11-10 11:10:05.363975
2019-11-10 11:10:05.418941
2019-11-10 11:10:05.435931
2019-11-10 11:10:07.347753
2019-11-10 11:10:07.364741
2019-11-10 11:10:07.419707
2019-11-10 11:10:07.436697
2019-11-10 11:10:09.348518
2019-11-10 11:10:09.365508
[0, 1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81]
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
由于我没有指定内核数量,因此使用了所有可用的内核(在我的机器4上)。在时间戳中可以看出:4个时间戳彼此接近。超过暂停的时间,直到再次释放内核。
您想使用一种方法matthews_corrcoef,该方法根据文档采用两个参数y_true和y_pred。
在使用该方法之前,让我们从上面修改测试方法以采用两个参数:
2019-11-10 11:10:05.346985
2019-11-10 11:10:05.363975
2019-11-10 11:10:05.418941
2019-11-10 11:10:05.435931
2019-11-10 11:10:07.347753
2019-11-10 11:10:07.364741
2019-11-10 11:10:07.419707
2019-11-10 11:10:07.436697
2019-11-10 11:10:09.348518
2019-11-10 11:10:09.365508
[0, 1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81]
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
从multiprocessing.pool.Pool的文档中,我们了解到,这map仅需要一个参数。因此,我将改为使用apply_async。作为apply_async返回结果对象而不是方法的返回值,我使用一个列表来存储结果并在这样的单独循环中获取返回值:
def fxy(x, y):
time.sleep(2)
print(datetime.datetime.utcnow())
return x*y
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
与第一种方法的输出类似:
2019-11-10 11:41:24.987093
0
2019-11-10 11:41:24.996087
1
2019-11-10 11:41:25.008079
2019-11-10 11:41:25.002083
4
9
2019-11-10 11:41:26.988859
16
2019-11-10 11:41:27.009847
2019-11-10 11:41:27.009847
25
36
2019-11-10 11:41:27.011845
49
2019-11-10 11:41:28.989623
64
2019-11-10 11:41:29.019606
81
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
现在开始matthews_corrcoef。对结果进行更好地核实(你pred和man当应用于抛出错误matthews_corrcoef),我使用的术语和值像的文档中的例子matthews_corrcoef。
if __name__ == '__main__':
with Pool() as p:
res = []
for i in range(10):
res.append(p.apply_async(fxy, args = (i, i)))
for item in res:
print(item.get())
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
结果如预期:
2019-11-10 11:49:07.309389
2019-11-10 11:49:07.345366
2019-11-10 11:49:07.375348
2019-11-10 11:49:07.393336
2019-11-10 11:49:07.412325
2019-11-10 11:49:07.412325
2019-11-10 11:49:07.412325
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
2019-11-10 11:49:07.420319
2019-11-10 11:49:07.420319
2019-11-10 11:49:07.413325
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
-0.3333333333333333
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
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