Anaconda ImportError：/usr/lib64/libstdc++.so.6：找不到版本“GLIBCXX_3.4.21”

Question

当我尝试在 conda 环境中运行 Python 脚本时，出现以下导入错误

(squad) azada@scholar-fe00:~/Desktop/Toy-Problem-Team-2 $ python3 train.py 
Traceback (most recent call last):
  File "train.py", line 21, in <module>
    from tensorboardX import SummaryWriter
  File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/__init__.py", line 5, in <module>
    from .torchvis import TorchVis
  File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/torchvis.py", line 11, in <module>
    from .writer import SummaryWriter
  File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/writer.py", line 15, in <module>
    from .event_file_writer import EventFileWriter
  File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/event_file_writer.py", line 28, in <module>
    from .proto import event_pb2
  File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/proto/event_pb2.py", line 7, in <module>
    from google.protobuf import descriptor as _descriptor
  File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/google/protobuf/descriptor.py", line 47, in <module>
    from google.protobuf.pyext import _message
ImportError: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21' not found (required by /home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/google/protobuf/pyext/_message.cpython-36m-x86_64-linux-gnu.so)

写入strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX命令有以下输出

GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.1
GLIBCXX_3.4.2
GLIBCXX_3.4.3
GLIBCXX_3.4.4
GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.6
GLIBCXX_3.4.7
GLIBCXX_3.4.8
GLIBCXX_3.4.9
GLIBCXX_3.4.10
GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.12
GLIBCXX_3.4.13
GLIBCXX_3.4.14
GLIBCXX_3.4.15
GLIBCXX_3.4.16
GLIBCXX_3.4.17
GLIBCXX_3.4.18
GLIBCXX_3.4.19
GLIBCXX_DEBUG_MESSAGE_LENGTH

如您所见，所需的libgcc版本不存在。GLIBCXX但我无法理解为什么 python在目录中查找/usr？

在我的 anaconda 环境中运行相同的命令libstdc++.so.6显示文件中存在所需的版本。

我正在使用大学的计算集群，因此我没有管理员权限。

有没有什么办法可以让Python使用libstdc++我的conda环境而不是目录中的环境/usr？

Answer 1

我花了一天的时间来解决这个问题，在我的研究大学的计算集群上工作时遇到了同样的问题，其规格与您相同，我终于找到了正确的 Stack Overflow线程。不幸的是，上面的答案都不起作用，但我可以非常有信心地说，链接线程中的详细信息应该可以解决您的问题，即使错误回溯的来源不同。

总而言之，您需要将文件夹的路径添加到tolib中：anacondaLD_LIBRARY_PATH

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/your/path/to/conda/env/lib

就我而言，我只是做了：

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/anaconda3/lib

...它就像一个魅力！

Answer 2

这也值得一试，因为它最终对我有用：

conda install -c conda-forge libstdcxx-ng

说明：我在尝试执行以下操作时收到此错误import tensorflow as tf：

ImportError: /opt/conda/bin/../lib/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.30' not found (required by /opt/conda/lib/python3.8/site-packages/tensorflow/python/_pywrap_tensorflow_internal.so)

我已经libgcc-ng安装了。还值得注意的是，我添加了 conda 库路径和附加到的系统库路径LD_LIBRARY_PATH，但这对我不起作用。所以，YMMV。

Answer 3

通过降级到 libgcc==5.2.0 来解决

最初，尝试使用 pip 安装，但如果出现错误：Could not download andcompile the C core of igraph.. install it by conda