我从哪里开始使用rJava？

Question

我不是Java程序员.我编写R和C++.我有一些我希望包含在R包中的java代码.该计划的基础是这样的:

1. 从标准输入读取数据.
2. 运行MCMC链.
3. 输出到文件.

我想将它转换为R,我可以从R运行程序.我熟悉Rcpp包,并习惯了它的一些便利.从哪里开始使用rJava包来学习使用此代码.

具体来说,我有以下问题.

1. 如何从R传输数据到java,例如数字向量,因子等.
2. 如何运行类的方法？
3. 如何在包中包含Java代码？

rJava文档不是很有帮助.有人有这方面的教程吗？

Answer 1

有一种"简单"的方法可以做到这一点,这是一种更难的方法.我是一个简单的人,所以我倾向于简单的解决方案:

myCommand <- paste("/path/to/java", argument1, argument2, sep=" ")
system(shQuote(myCommand))

然后使用任何有意义的R函数读入输出文件.

更难的解决方案是编辑Java代码,使其不从stdin读取,而是传递一个向量或其他Java对象.我不能真正概括如何改变你的Java代码,但如果最终需要为一个向量提供Java函数,你可以这样做:

.jinit()
v <- .jnew("java/util/Vector")
rVector <- as.character(1:10)
addToV <- function( item ){
  v$add( item )
}
sapply(rVector, addToV)

我总是发现在rJava中处理类型是一个相当大的痛苦,正如你在上面看到的那样.

为您节省大量时间的一个技巧是:当您在rJava中创建Java对象时,您可以通过键入名称,美元符号然后单击选项卡来确定其方法.所以使用上面创建的v对象输入"v $",你应该得到这个:

1> v$
v$add(                 v$hashCode()           v$contains(            v$size()               v$elementAt(           v$capacity()           v$containsAll(         v$firstElement()       v$removeElement(       v$iterator()           v$wait()
v$get(                 v$clone()              v$isEmpty()            v$toArray()            v$remove(              v$ensureCapacity(      v$removeAll(           v$insertElementAt(     v$removeElementAt(     v$listIterator()       v$getClass()
v$equals(              v$indexOf(             v$lastIndexOf(         v$toArray(             v$elements()           v$trimToSize()         v$retainAll(           v$lastElement()        v$setElementAt(        v$listIterator(        v$notify()
v$toString()           v$clear()              v$addAll(              v$addElement(          v$set(                 v$subList(             v$copyInto(            v$removeAllElements()  v$setSize(             v$wait(                v$notifyAll()
1> v$

祝你好运,如果你有特殊的障碍,一定要大喊大叫.