如何使用readline()从第二行开始?

Fra*_*cis 5 python

我正在用Python编写一个简短的程序来读取FASTA文件,该文件通常采用以下格式:

>gi|253795547|ref|NC_012960.1| Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome, 52 lines
GACGGCTTGTTTGCGTGCGACGAGTTTAGGATTGCTCTTTTGCTAAGCTTGGGGGTTGCGCCCAAAGTGA
TTAGATTTTCCGACAGCGTACGGCGCGCGCTGCTGAACGTGGCCACTGAGCTTACACCTCATTTCAGCGC
TCGCTTGCTGGCGAAGCTGGCAGCAGCTTGTTAATGCTAGTGTTGGGCTCGCCGAAAGCTGGCAGGTCGA
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我已经创建了另一个程序来读取这个FASTA文件的第一行(又名标题),现在我希望第二个程序从序列开始读取和打印.

我该怎么办?

到目前为止我有这个:

FASTA = open("test.txt", "r")

def readSeq(FASTA):
    """returns the DNA sequence of a FASTA file"""
    for line in FASTA:
        line = line.strip()
        print line          


readSeq(FASTA)
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多谢你们

-菜鸟

Joh*_*hin 5

def readSeq(FASTA):
    """returns the DNA sequence of a FASTA file"""
    _unused = FASTA.next() # skip heading record
    for line in FASTA:
        line = line.strip()
        print line  
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阅读关于file.next的文档() ,看看为什么你应该警惕混合file.readline()使用for line in file:


kur*_*umi 4

你应该展示你的脚本。从第二行读取,类似这样

f=open("file")
f.readline()
for line in f:
    print line
f.close()
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