ggplot2：如何使点与小提琴图分组？

Question

我想绘制x轴在哪里的小提琴图，exon但是我想对这些图进行分组。如果它只是小提琴，这是可行的，但是当我由于某种原因添加抖动时，它没有响应正确aes，而是自行绘制？这是一个可复制的代码，其中包含错误的屏幕快照。谢谢！

set.seed(1)
df <- data.frame(
  exons = c(rep("e1", 200), rep("e2", 200)),
  values = rnorm(400, 200, 40),
  group = c(
    rep("g1", 75), rep("g2", 75), rep("g3", 50),
    rep("g1", 75), rep("g2", 75), rep("g3", 50)
  )
)

ggplot(df, aes(y = values, x = exons, fill = group)) +
  geom_violin() +
  geom_jitter(shape = 16, position = position_jitter(0.07))

因此，如果绘图有效，则应该在每个外显子的每个组内绘制点，但是这里显然不是。

Answer 1

你可能都想要position_dodge()并且position_jitterdodge()

library(ggplot2)
ggplot(df, aes(y = values, x = exons, fill = group)) +
  geom_violin(position = position_dodge(width = 0.9)) +
  geom_point(position = position_jitterdodge(seed = 1, dodge.width = 0.9))

另一个值得一提的选项是包geom_quasirandom()中的函数ggbeeswarm

library(ggbeeswarm)
ggplot(df, aes(y = values, x = exons, fill = group)) +
  geom_violin(position = position_dodge(width = 0.9)) +
  geom_quasirandom(dodge.width = 0.9, varwidth = TRUE)

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