使R安装自包含/独立于用户

Question

我试图让R忽略c：\ users \ name \ documents并完全独立/可移植

这是我的目录结构：

.../R/R-2.1.2.2/...
.../R/r_user/
.../R/libs_site/

我更新了Rprofile.site如下：

# Set the working directory
setwd( file.path( R.home() , ".." , "r_user" ) )

# set the home directory
Sys.setenv(HOME=file.path( R.home() , ".." , "r_user" )  )

# Set the site library folder
.Library.site = file.path( R.home() , ".." , "libs_site" )

当R启动时，我运行.libPaths（），但仍然看到c：/ users / ...

因此，也许R不是按照上面的Sys.setenv更新？解决方案？

Answer 1

以我的经验，创建一个名为Renviron.site的文件并不能在我的所有Windows计算机上正常工作，而命名同一个文件。不知道为什么。因此，如果您对上述建议有困难，请尝试使用.Renviron作为名称。

请不要犹豫，批评我的建议，因为当我描述对我有用的东西时，可能会有我不知道的困难。

以我的经验，以下工作有效：

Windows和Linux平台：

设置R路径

找出默认路径：.libPaths（）

临时设置路径（在R脚本中）

.libPaths( "F:/Rlib" )

其中F可能是与USB驱动器相关的字母。

查询路径（Windows和Linux）：

Sys.getenv('R_LIBS_USER')
Sys.getenv('R_LIBS')
Sys.getenv('R_USER')
Sys.getenv('R_DOC_DIR')
Sys.getenv('HOME')

也尝试：

normalizePath("~")

也尝试：

getwd()
setwd(dir)

getwd返回表示R进程当前工作目录的绝对文件路径

setwd（dir）用于将工作目录设置为dir。

Windows（经过7x64测试）

创建一个名为.Renviron的环境文件，将其放置在工作目录或主目录中：

"C:/Users/username/Documents"

一些用户报告说，.Renviron文件需要位于“ c：/ users / username /”中。如果不确定将其放置在何处，请保存桌面历史记录，然后查看.Rhistory文件的位置。然后，将您的.Renviron文件放在同一位置。保存历史savehistory（）

# Windows .Renviron file:
R_LIBS_USER="C:/R/library"
R_USER="C:/R"
R_DOC_DIR="C:/R"
HOME="C:"

设置全局PATH我的电脑/属性/高级系统设置/环境变量->用户变量->路径->编辑c：\ R; c：\ R \ library;

Linux（在kUbuntu 12.10上测试）

创建一个名为Renviron.site的环境文件，并将其放在以下位置：

/etc/R/

查询路径以检查系统是否正在读取Renviron.site文件。

# Linux Renviron.site file:
R_LIBS_USER="~/R/library"
R_USER="~/R"
R_DOC_DIR="~/R" 
#HOME="/home" # may not be needed

备注：afaik从底部到顶部读取文件，因此在底部定义了HOME。在我的设置中，〜已正确分配给/ home /，因此无论如何我都省略了最后一行。

如果使用RStudio，则可能还需要在RStudio程序目录中添加一个rsession.conf文件。以下对我有用：

# Windows 7:
r-libs-user="C:/R/library"
# Kubuntu 12:
# r-libs-user=~/R/%p-library/%v