pos*_*ion 2 plot r ggplot2 rpart
我使用 rpart 训练了一个模型,我想生成一个图,显示用于决策树的变量的变量重要性,但我不知道如何做。
我能够提取变量重要性。我尝试过 ggplot 但没有显示任何信息。我尝试在其上使用plot()函数,但它只给我一个平面图。我还尝试了plot.default,它好一点,但仍然是我想要的。
这是 rpart 模型训练:
argIDCART = rpart(Argument ~ .,
data = trainSparse,
method = "class")
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将变量重要性放入数据框中。
argPlot <- as.data.frame(argIDCART$variable.importance)
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这是打印内容的一部分:
argIDCART$variable.importance
noth 23.339346
humanitarian 16.584430
council 13.140252
law 11.347241
presid 11.231916
treati 9.945111
support 8.670958
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我想绘制一个图表来显示变量/特征名称及其数字重要性。我就是无法让它做到这一点。它似乎只有一列。我尝试使用单独的函数将它们分开,但也无法做到这一点。
ggplot(argPlot, aes(x = "variable importance", y = "feature"))
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只是打印空白。
其他情节看起来真的很糟糕。
plot.default(argPlot)
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看起来它绘制了点,但没有放置变量名称。
由于没有可重现的示例,我使用 ggplot2 包和其他数据操作包基于自己的 R 数据集安装了我的响应。
library(rpart)
library(tidyverse)
fit <- rpart(Kyphosis ~ Age + Number + Start, data = kyphosis)
df <- data.frame(imp = fit$variable.importance)
df2 <- df %>%
tibble::rownames_to_column() %>%
dplyr::rename("variable" = rowname) %>%
dplyr::arrange(imp) %>%
dplyr::mutate(variable = forcats::fct_inorder(variable))
ggplot2::ggplot(df2) +
geom_col(aes(x = variable, y = imp),
col = "black", show.legend = F) +
coord_flip() +
scale_fill_grey() +
theme_bw()
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ggplot2::ggplot(df2) +
geom_segment(aes(x = variable, y = 0, xend = variable, yend = imp),
size = 1.5, alpha = 0.7) +
geom_point(aes(x = variable, y = imp, col = variable),
size = 4, show.legend = F) +
coord_flip() +
theme_bw()
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