diz*_*q22 5 python numpy eigen pybind11
我有一个使用 eigen 的 C++ 函数,它使用 pybind11 包装,以便我可以从 python 调用它。预期函数的简单版本返回一个Eigen::MatrixXd类型,pybind 成功地将其转换为 2D numpy 数组。
我希望这个函数能够返回此类矩阵的列表或元组,或者 3D numpy 数组。
我在某种程度上是 C++ 的新手,并且 pybind 的文档没有(据我所知)提供任何方向。一个模拟示例如下:
测试.cpp
#include <pybind11/pybind11.h>
#include <pybind11/eigen.h>
#include <Eigen/Dense>
Eigen::MatrixXd test(Eigen::Ref<const Eigen::MatrixXd> x, double a)
{
Eigen::MatrixXd y;
y = x * a;
return y;
}
Eigen::MatrixXd *test2(Eigen::Ref<const Eigen::MatrixXd> x, Eigen::Ref<const Eigen::VectorXd> as)
{
Eigen::MatrixXd *ys = new Eigen::MatrixXd[as.size()];
for(unsigned int k = 0; k < as.size(); k++){
Eigen::MatrixXd& y = ys[k];
y = x * as[k];
}
return ys;
}
namespace py = pybind11;
PYBIND11_MODULE(test, m)
{
m.doc() = "minimal working example";
m.def("test", &test);
m.def("test2", &test2);
}
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我想test2返回数组列表或元组。
在Python中:
import test
import numpy as np
x = np.random.random((50, 50))
x = np.asfortranarray(x)
a = 0.1
a2 = np.array([1.0, 2.0, 3.0])
y = test.test(x, a)
ys = test.test2(x, a2)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
该数组y与预期一致,但ys仅包含与 的第一个系数对应的数组a2。
我应该如何修改test2才能正确返回多个数组?3D 阵列也是可以接受的。
我以前使用过 Eigen,但我不是专家,所以其他人也许能够改进这个解决方案。
#include <pybind11/pybind11.h>
#include <pybind11/eigen.h>
#include <pybind11/stl.h>
#include <Eigen/Dense>
std::vector<Eigen::MatrixXd>
test2(Eigen::Ref<const Eigen::MatrixXd> x, Eigen::Ref<const Eigen::VectorXd> as){
std::vector<Eigen::MatrixXd> matrices;
for(unsigned int k = 0; k < as.size(); k++){
Eigen::MatrixXd ys = x * as[k];
matrices.push_back(ys);
}
return matrices;
}
namespace py = pybind11;
PYBIND11_MODULE(test, m){
m.doc() = "minimal working example";
m.def("test2", &test2);
}
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该向量由 pybind11 转换为 numpy 数组列表。结果:
In [1]: import numpy as np; x = np.ones((2,2)); a = np.array((2., 3.)); import test
In [2]: test.test2(x, a)
Out[2]:
[array([[2., 2.],
[2., 2.]]), array([[3., 3.],
[3., 3.]])]
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