Matlab中“内存不足”错误的解决方案

Question

我有一个很大的文本文件大小（大约11GB），需要在matlab中加载。但是当我使用“文本读取”功能时，会出现“内存不足”错误。并且无法减小文件大小。当我键入内存时，请告诉我。

memory
Maximum possible array:     24000 MB (2.517e+10 bytes) *
Memory available for all arrays:     24000 MB (2.517e+10 bytes) *
Memory used by MATLAB:      1113 MB (1.167e+09 bytes)
Physical Memory (RAM):     16065 MB (1.684e+10 bytes)

*  Limited by System Memory (physical + swap file) available.

有谁能解决这个问题？

Answer 1

@Anthony提出了一种逐行读取文件的方法，这非常好，但是最新版本的（> = R2014b）MATLAB具有datastore功能，该功能旨在处理大数据块。

datastore根据文本文件的格式，有几种可用的类型。在最简单的情况下（例如CSV文件），自动检测效果很好，您可以简单地说

ds = datastore('myCsvFile.csv');
while hasdata(ds)
    chunkOfData = read(ds);
    ... compute with chunkOfData ...
end

在更新的（> = R2016b）版本的MATLAB中，您可以更进一步，并将其包装datastore到tall数组中。tall数组使您可以处理太大而无法一次全部放入内存的数据。（在幕后，tall数组以块的形式执行计算，并且仅当您通过调用来提供结果时才为您提供结果gather）。例如：

tt = tall(datastore('myCsvFile.csv'));
data = tt.SomeVariable;
result = gather(mean(data)); % Trigger tall array evaluation