ROC 函数错误“预测器必须是数字或有序的。”

Question

我无法使 ROC 函数工作，出现错误“预测器必须是数字或有序”。

我浏览了其他帖子，但没有解决我的问题。任何帮助都受到高度赞赏。

"Get data"
flying=dget("https://www.math.ntnu.no/emner/TMA4268/2019v/data/flying.dd")
ctrain=flying$ctrain
ctest=flying$ctest


library(MASS)
fly_qda=qda(diabetes~., data=ctrain)


#Test error is given below:
predict_qda=predict(fly_qda, newdata=ctest, probability=TRUE)
table_qda<-table(ctest$diabetes, predict_qda$class)
error_qda<-1-sum(diag(table_qda))/sum(table_qda)
error_qda

"ROC curve and AUC"
predict_qdatrain<-predict(fly_qda, newdata=ctrain)
roc_qda=roc(response=ctrain$diabetes, predictor= predict_qdatrain$class, plot=TRUE)
plot(roc_qda, col="red", lwd=3, main="ROC curve QDA")
auc_qda<-auc(roc_qda)

我想要绘制的 ROC 曲线和 AUC

Answer 1

正如 Ollie Perkins 在他的回答中所解释的那样，你得到的错误表明你传递的东西不是可排序的，因此不能用于 ROC 分析。在 的情况下predict.qda，该class项目是具有1s 和0s 表示类别。

与其将类转换为有序预测器，不如使用后验概率。让我们使用属于 class 的概率1：

roc_qda <- roc(response = ctrain$diabetes, predictor = predict_qdatrain$posterior[,"1"])
plot(roc_qda, col="red", lwd=3, main="ROC curve QDA")
auc(roc_qda)

这将为您提供更平滑的曲线和更多可供选择的分类阈值。