如何获取我在RStudio中运行的脚本的所有输出

Question

我想看看有149行的脚本输出.一直到脚本都有我想看的表.我正在使用RStudio IDE.在过去,我使用过Tinn-R.我将运行整个脚本,代码行和打印对象将在控制台中可见.

例如,这是一段摘录

attach(uniquehuman.race.eth)
partA.eth <-table(Ethnicity, Sex,useNA="ifany")
partA.eth
margin.table(partA.eth,1)#row totals
margin.table(partA.eth,2)#column totals
nrow(uniquehuman.race.eth)#total logged in

上面的代码将给出表格的文本输出和我需要的数字.然后我可以保存控制台或将整个事物复制并粘贴到文本文件中.

我怎么能在RStudio中做到这一点？我最接近它的是在每一行上按CTRL-ENTER,但我不想这样做149次.如果我点击CTRL-SHIFT-ENTER进行"全部运行",则R处理所有数据并将对象放入内存,但我看不到输出.

请告诉我如何查看所有输出和/或将输出发送到文本文件.

Answer 1

我是RStudio开发人员之一.感谢您的反馈 - 我会记录一个错误.

与此同时,一个解决方法是source(filename, echo=T)从控制台执行.

Answer 2

您只需选择要运行的代码,然后按CTRL+ENTER即可在RStudio中执行所需操作.这适用于多行,与Tinn-R完全相同.如果您想以冗长的方式一次性运行所有内容,请按CTRL-A CTRL-ENTER.

作为保存到文本文件的另一个选项,您可以检查?sink:

sink(file='path/to/somefile.ext')
... # the code generating output
sink()

sink()将控制台的所有输出重定向到连接,在本例中为某个文件.请注意,这只是标准输出,而不是警告或错误.这个命令也派上用场,以创建分析输出文件,结合print(),cat(),sprintf()等.

如果在RStudio中使用"run all",则必须明确使用任何提到的函数来生成文件的输出.原则上,如果您运行整个脚本,RStudio将以静默方式运行.