将多个 StandardScaler 应用于单个组?

pst*_*ohn 5 python pandas scikit-learn

是否有一种 pythonic 方法可以将 sklearn 的 StandardScaler 实例链接在一起以独立地按组缩放数据?即,如果我想找到独立缩放 iris 数据集的特征;我可以使用以下代码:

from sklearn.datasets import load_iris
data = load_iris()
df = pd.DataFrame(data['data'], columns=data['feature_names'])
df['class'] = data['target']

means = df.groupby('class').mean()
stds = df.groupby('class').std()

df_rescaled = (
    (df.drop(['class'], 1) - means.reindex(df['class']).values) / 
     stds.reindex(df['class']).values)
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在这里,我分别减去均值并除以每个组的标准差。但是它有点难以实现这些手段和标准差,并且基本上复制了StandardScaler当我有一个我想要控制的分类变量时的行为。

有没有更pythonic/sklearn友好的方式来实现这种类型的缩放?

Szy*_*zke 8

当然,您可以使用任何sklearn操作并将其应用于groupby对象。

首先,一个方便的包装器:

import typing
import pandas as pd

class SklearnWrapper:
    def __init__(self, transform: typing.Callable):
        self.transform = transform

    def __call__(self, df):
        transformed = self.transform.fit_transform(df.values)
        return pd.DataFrame(transformed, columns=df.columns, index=df.index)
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这将应用sklearn您传递给它的任何变换到一个组。

最后简单的用法:

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.preprocessing import StandardScaler

data = load_iris()
df = pd.DataFrame(data["data"], columns=data["feature_names"])
df["class"] = data["target"]

df_rescaled = (
    df.groupby("class")
    .apply(SklearnWrapper(StandardScaler()))
    .drop("class", axis="columns")
)
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编辑:你几乎可以用SklearnWrapper. 这是为每个组转换和反转此操作的示例(例如,不要覆盖转换对象) - 每次看到新组时只需重新拟合对象(并将其添加到list)。

sklearn's为了更容易使用,我复制了一些功能(您可以通过将适当的传递string_call_with_function内部方法来使用您想要的任何功能扩展它):

class SklearnWrapper:
    def __init__(self, transformation: typing.Callable):
        self.transformation = transformation
        self._group_transforms = []
        # Start with -1 and for each group up the pointer by one
        self._pointer = -1

    def _call_with_function(self, df: pd.DataFrame, function: str):
        # If pointer >= len we are making a new apply, reset _pointer
        if self._pointer >= len(self._group_transforms):
            self._pointer = -1
        self._pointer += 1
        return pd.DataFrame(
            getattr(self._group_transforms[self._pointer], function)(df.values),
            columns=df.columns,
            index=df.index,
        )

    def fit(self, df):
        self._group_transforms.append(self.transformation.fit(df.values))
        return self

    def transform(self, df):
        return self._call_with_function(df, "transform")

    def fit_transform(self, df):
        self.fit(df)
        return self.transform(df)

    def inverse_transform(self, df):
        return self._call_with_function(df, "inverse_transform")
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用法(组变换,逆运算并再次应用):

data = load_iris()
df = pd.DataFrame(data["data"], columns=data["feature_names"])
df["class"] = data["target"]

# Create scaler outside the class
scaler = SklearnWrapper(StandardScaler())

# Fit and transform data (holding state)
df_rescaled = df.groupby("class").apply(scaler.fit_transform)

# Inverse the operation
df_inverted = df_rescaled.groupby("class").apply(scaler.inverse_transform)

# Apply transformation once again
df_transformed = (
    df_inverted.groupby("class")
    .apply(scaler.transform)
    .drop("class", axis="columns")
)
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