如何使用 qalter 清除 PBS 作业依赖性？

Question

假设我向集群发送了一个具有依赖项的作业qsub -W depend=afterok:JOBID，如何使用 qalter 命令清除它（使用 PBSpro 调度程序）？我在qalter 手册页中找到了一些信息，但找不到如何清除它，只是如何创建新的依赖项。

Answer 1

在一些朋友的帮助下，我得到了答案，显然我必须提交一个qalter命令来改变依赖关系，但不是指定一个新的JOBID，而是省略:JOBID.

例子：

提交一项取决于前一项工作成功完成的工作（例如1234）

qsub -q my_queue -l ... -W depend=afterok:1234 file.pbs

新提交的作业将保持暂停状态，直到作业1234完成并显示ExitStatus:0。我们可以使用命令检查新提交的作业的JobId和状态qstat（其状态应为H（表示保留），并表示其Id为1235）。然后，如果我们决定不需要等待第一个命令完成，我们可以清除依赖关系：

qalter -W depend=afterok 1235

请注意，我省略了冒号和后面的依赖项 Id afterok，这qalter需要将其更改的 JobId 作为最后一个参数。