语义图像分割NN(DeepLabV3 +)的内存过多问题

Mob*_*Mob 5 python keras tensorflow semantic-segmentation deeplab

我首先解释一下我的任务:我从两条不同的绳索上获得了近3000张图像。它们包含绳索1,绳索2和背景。我的标签/遮罩是图像,例如像素值0表示背景,像素值1表示第一根绳子,而2表示第二根绳子。您可以在下面的图片1和2中看到输入图片和地面真理/标签。请注意,我的地面真相/标签只有3个值:0、1和2。我的输入图片是灰色的,但对于DeepLab,我将其转换为RGB图片,因为DeepLab是在RGB图片上训练的。但是我转换后的图片仍然不包含颜色。

这是我的网络的输入图片 这是基本事实 原始彩色图像

该任务的思想是神经网络应该从绳索中学习结构,因此即使有knote,它也可以正确标记绳索。因此颜色信息并不重要,因为我的绳索具有不同的颜色,因此可以很容易地使用KMeans创建地面真相/标签。

为此,我在Keras中选择了一个名为DeepLab V3 +的语义分割网络,并以TensorFlow作为后端。我想用我的近3000张图像训练NN。图片的大小小于100MB,均为300x200像素。也许DeepLab并不是我的任务的最佳选择,因为我的图片不包含颜色信息并且图片的尺寸很小(300x200),但是到目前为止,我没有找到更好的语义分割NN。

从Keras网站,我知道如何使用flow_from_directory加载数据以及如何使用fit_generator方法。我不知道我的代码是否逻辑正确...

这里是链接:

https://keras.io/preprocessing/image/

https://keras.io/models/model/

https://github.com/bonlime/keras-deeplab-v3-plus

我的第一个问题是:

在我的实现中,我的图形卡几乎使用了所有内存(11GB)。我不知道为什么 DeepLab的权重可能有那么大吗?我的Batchsize默认为32,我所有的近300张图像都小于100MB。我已经使用过config.gpu_options.allow_growth = True代码,请参见下面的代码。

一般问题:

有人知道我的任务有很好的语义分割NN吗?我不需要经过彩色图像训练的神经网络。但是我也不需要NN,它是用二进制地面真实图片训练的...我用DeepLab测试了我的原始彩色图像(图片3),但是我得到的结果标签不好...

到目前为止,这是我的代码:

import os
os.environ["CUDA_VISIBLE_DEVICES"] = "3"

import numpy as np
from model import Deeplabv3
import tensorflow as tf
import time
import tensorboard
import keras
from keras.preprocessing.image import img_to_array
from keras.applications import imagenet_utils
from keras.preprocessing.image import ImageDataGenerator
from keras.callbacks import TensorBoard


config = tf.ConfigProto()
config.gpu_options.allow_growth = True
session = tf.Session(config=config)

from keras import backend as K
K.set_session(session)

NAME = "DeepLab-{}".format(int(time.time()))

deeplab_model = Deeplabv3(input_shape=(300,200,3), classes=3)

tensorboard = TensorBoard(log_dir="logpath/{}".format(NAME))

deeplab_model.compile(loss="categorical_crossentropy", optimizer="adam", metrics=['accuracy'])

# we create two instances with the same arguments
data_gen_args = dict(featurewise_center=True,
                     featurewise_std_normalization=True,
                     rotation_range=90,
                     width_shift_range=0.1,
                     height_shift_range=0.1,
                     zoom_range=0.2)
image_datagen = ImageDataGenerator(**data_gen_args)
mask_datagen = ImageDataGenerator(**data_gen_args)

# Provide the same seed and keyword arguments to the fit and flow methods
seed = 1
#image_datagen.fit(images, augment=True, seed=seed)
#mask_datagen.fit(masks, augment=True, seed=seed)

image_generator = image_datagen.flow_from_directory(
    '/path/Input/',
    target_size=(300,200),
    class_mode=None,
    seed=seed)

mask_generator = mask_datagen.flow_from_directory(
    '/path/Label/',
    target_size=(300,200),
    class_mode=None,
    seed=seed)

# combine generators into one which yields image and masks
train_generator = zip(image_generator, mask_generator)

print("compiled")

#deeplab_model.fit(X, y, batch_size=32, epochs=10, validation_split=0.3, callbacks=[tensorboard])
deeplab_model.fit_generator(train_generator, steps_per_epoch= np.uint32(2935 / 32), epochs=10, callbacks=[tensorboard])

print("finish fit")
deeplab_model.save_weights('deeplab_1.h5')
deeplab_model.save('deeplab-1')

session.close()
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

这是我测试DeepLab的代码(来自Github):

from matplotlib import pyplot as plt
import cv2 # used for resize. if you dont have it, use anything else
import numpy as np
from model import Deeplabv3
import tensorflow as tf
from PIL import Image, ImageEnhance

deeplab_model = Deeplabv3(input_shape=(512,512,3), classes=3)
#deeplab_model = Deeplabv3()
img = Image.open("Path/Input/0/0001.png")
imResize = img.resize((512,512), Image.ANTIALIAS)
imResize = np.array(imResize)
img2 = cv2.cvtColor(imResize, cv2.COLOR_GRAY2RGB)

w, h, _ = img2.shape
ratio = 512. / np.max([w,h])
resized = cv2.resize(img2,(int(ratio*h),int(ratio*w)))
resized = resized / 127.5 - 1.
pad_x = int(512 - resized.shape[0])
resized2 = np.pad(resized,((0,pad_x),(0,0),(0,0)),mode='constant')
res = deeplab_model.predict(np.expand_dims(resized2,0))
labels = np.argmax(res.squeeze(),-1)
plt.imshow(labels[:-pad_x])
plt.show()
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

Fra*_*Jey 3

第一个问题:DeepLabV3+ 是一个非常大的模型(我假设您使用的是 Xception 主干?!),对于 bachsize 为 32、像素为 200x300 的 bachsize 而言,11 GB 的所需 GPU 容量是完全正常的:)(训练 DeeplabV3+,我需要大约11 GB,使用批量大小为 5,像素为 500x500)。请注意您的问题的第二句话:所需的 GPU 资源受到许多因素(模型、优化器、批量大小、图像裁剪、预处理等)的影响,但数据集集的实际大小不应影响它。因此,您的数据集大小是 300MB 还是 300GB 并不重要。

一般问题:您正在使用一个小数据集。选择 DeeplabV3+ 和 Xception 可能不太合适,因为模型可能太大。这可能会导致过度拟合。如果您尚未获得满意的结果,您可以尝试较小的网络。如果您想坚持使用 DeepLab 框架,您可以将骨干网络从 Xception 网络切换到 MobileNetV2(在官方张量流版本中它已经实现)。或者,您可以尝试使用独立网络,例如带有 FCN 头的 Inception 网络...

在每种情况下,都必须使用具有经过良好训练的特征表示的预训练编码器。如果您没有找到基于灰度输入图像的所需模型的良好初始化,只需使用在 RGB 图像上预训练的模型并使用灰度数据集扩展预训练(基本上您可以将任何大的 RGB 数据集转换为灰度)并在使用数据之前微调灰度输入的权重。

我希望这有帮助!干杯,弗兰克