使用conda安装软件包如何更改我的python版本并删除co​​nda?

use*_*262 12 anaconda conda

我一直在将蟒蛇与蟒蛇2.7一起使用

$ python
Python 2.7.14 |Anaconda custom (64-bit)| (default, Dec  7 2017, 17:05:42) 
[GCC 7.2.0] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

当我决定安装tensorflow时(由于某种原因,我使用了非gpu版本)

我使用的命令是:

$ conda install -c anaconda tensorflow-gpu
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

但是,完成后(此cmd的输出详细信息如下),我不再需要conda了:

$ conda install -c conda-forge keras
Traceback (most recent call last):
  File "/home/me/anaconda2/bin/conda", line 12, in <module>
    from conda.cli import main
ModuleNotFoundError: No module named 'conda'
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

(注意:我也不再拥有Keras),现在正在运行Python 3.7(!?):

$ python
Python 3.6.8 |Anaconda, Inc.| (default, Dec 30 2018, 01:22:34) 
[GCC 7.3.0] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> 
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

发生了什么?如何阻止它再次发生?这之前发生过一次,我最终删除了所有anaconda文件,然后重新安装。我不想养成这种习惯。

我的输出conda install是:

$ conda install -c anaconda tensorflow-gpu
Collecting package metadata: done
Solving environment: done

## Package Plan ##

  environment location: /home/me/anaconda2

  added / updated specs:
    - tensorflow-gpu


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    _tflow_190_select-0.0.1    |              gpu           2 KB  anaconda
    absl-py-0.7.0              |           py36_0         156 KB  anaconda
    astor-0.7.1                |           py36_0          43 KB  anaconda
    c-ares-1.15.0              |       h7b6447c_1          98 KB  anaconda
    ca-certificates-2018.12.5  |                0         123 KB  anaconda
    certifi-2018.11.29         |           py36_0         146 KB  anaconda
    cudatoolkit-9.0            |       h13b8566_0       340.4 MB  anaconda
    cudnn-7.1.2                |        cuda9.0_0       367.8 MB  anaconda
    cupti-9.0.176              |                0         1.6 MB  anaconda
    curl-7.63.0                |    hbc83047_1000         145 KB  anaconda
    gast-0.2.2                 |           py36_0         138 KB  anaconda
    git-2.11.1                 |                0         9.5 MB  anaconda
    grpcio-1.16.1              |   py36hf8bcb03_1         1.1 MB  anaconda
    krb5-1.16.1                |       h173b8e3_7         1.4 MB  anaconda
    libcurl-7.63.0             |    h20c2e04_1000         550 KB  anaconda
    libedit-3.1.20181209       |       hc058e9b_0         188 KB  anaconda
    libssh2-1.8.0              |       h1ba5d50_4         233 KB  anaconda
    markdown-3.0.1             |           py36_0         107 KB  anaconda
    mkl_fft-1.0.10             |   py36ha843d7b_0         170 KB  anaconda
    mkl_random-1.0.2           |   py36hd81dba3_0         407 KB  anaconda
    ncurses-6.1                |       he6710b0_1         958 KB  anaconda
    numpy-1.15.4               |   py36h7e9f1db_0          47 KB  anaconda
    numpy-base-1.15.4          |   py36hde5b4d6_0         4.3 MB  anaconda
    openssl-1.1.1              |       h7b6447c_0         5.0 MB  anaconda
    pip-18.1                   |           py36_0         1.8 MB  anaconda
    protobuf-3.5.2             |   py36hf484d3e_1         610 KB  anaconda
    python-3.6.8               |       h0371630_0        34.4 MB  anaconda
    qt-4.8.7                   |                2        34.1 MB  anaconda
    setuptools-40.6.3          |           py36_0         625 KB  anaconda
    six-1.12.0                 |           py36_0          22 KB  anaconda
    sqlite-3.26.0              |       h7b6447c_0         1.9 MB  anaconda
    tensorboard-1.9.0          |   py36hf484d3e_0         3.3 MB  anaconda
    tensorflow-1.9.0           |gpu_py36h02c5d5e_1           3 KB  anaconda
    tensorflow-base-1.9.0      |gpu_py36h6ecc378_0       170.8 MB  anaconda
    tensorflow-gpu-1.9.0       |       hf154084_0           2 KB  anaconda
    termcolor-1.1.0            |           py36_1           7 KB  anaconda
    tk-8.6.8                   |       hbc83047_0         3.1 MB  anaconda
    werkzeug-0.14.1            |           py36_0         423 KB  anaconda
    wheel-0.32.3               |           py36_0          35 KB  anaconda
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:       985.7 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

  _tflow_190_select  anaconda/linux-64::_tflow_190_select-0.0.1-gpu
  c-ares             anaconda/linux-64::c-ares-1.15.0-h7b6447c_1
  cudatoolkit        anaconda/linux-64::cudatoolkit-9.0-h13b8566_0
  cudnn              anaconda/linux-64::cudnn-7.1.2-cuda9.0_0
  cupti              anaconda/linux-64::cupti-9.0.176-0
  krb5               anaconda/linux-64::krb5-1.16.1-h173b8e3_7
  pip                anaconda/linux-64::pip-18.1-py36_0
  tensorflow-gpu     anaconda/linux-64::tensorflow-gpu-1.9.0-hf154084_0

The following packages will be UPDATED:

  absl-py            conda-forge/noarch::absl-py-0.1.10-py~ --> anaconda/linux-64::absl-py-0.7.0-py36_0
  ca-certificates    conda-forge::ca-certificates-2018.11.~ --> anaconda::ca-certificates-2018.12.5-0
  curl                    pkgs/main::curl-7.60.0-h84994c4_0 --> anaconda::curl-7.63.0-hbc83047_1000
  gast                                         0.2.0-py27_0 --> 0.2.2-py36_0
  grpcio             pkgs/main::grpcio-1.12.1-py27hdbcaa40~ --> anaconda::grpcio-1.16.1-py36hf8bcb03_1
  libcurl              pkgs/main::libcurl-7.60.0-h1ad7b7a_0 --> anaconda::libcurl-7.63.0-h20c2e04_1000
  libedit                 pkgs/main::libedit-3.1-heed3624_0 --> anaconda::libedit-3.1.20181209-hc058e9b_0
  markdown           conda-forge/noarch::markdown-2.6.11-p~ --> anaconda/linux-64::markdown-3.0.1-py36_0
  mkl_fft            pkgs/main::mkl_fft-1.0.6-py27hd81dba3~ --> anaconda::mkl_fft-1.0.10-py36ha843d7b_0
  ncurses                 pkgs/main::ncurses-6.0-h9df7e31_2 --> anaconda::ncurses-6.1-he6710b0_1
  openssl            conda-forge::openssl-1.0.2p-h14c3975_~ --> anaconda::openssl-1.1.1-h7b6447c_0
  protobuf           conda-forge::protobuf-3.5.2-py27hd28b~ --> anaconda::protobuf-3.5.2-py36hf484d3e_1
  python               pkgs/main::python-2.7.14-h1571d57_29 --> anaconda::python-3.6.8-h0371630_0
  setuptools            pkgs/main::setuptools-38.4.0-py27_0 --> anaconda::setuptools-40.6.3-py36_0
  six                  pkgs/main::six-1.11.0-py27h5f960f1_1 --> anaconda::six-1.12.0-py36_0
  sqlite                pkgs/main::sqlite-3.23.1-he433501_0 --> anaconda::sqlite-3.26.0-h7b6447c_0
  tensorflow           conda-forge::tensorflow-1.3.0-py27_0 --> anaconda::tensorflow-1.9.0-gpu_py36h02c5d5e_1
  tk                         pkgs/main::tk-8.6.7-hc745277_3 --> anaconda::tk-8.6.8-hbc83047_0
  wheel              pkgs/main::wheel-0.30.0-py27h2bc6bb2_1 --> anaconda::wheel-0.32.3-py36_0

The following packages will be SUPERSEDED by a higher-priority channel:

  certifi            conda-forge::certifi-2018.11.29-py27_~ --> anaconda::certifi-2018.11.29-py36_0
  git                 pkgs/main::git-2.17.0-pl526hb75a9fb_0 --> anaconda::git-2.11.1-0
  libssh2               pkgs/main::libssh2-1.8.0-h9cfc8f7_4 --> anaconda::libssh2-1.8.0-h1ba5d50_4
  mkl_random         pkgs/main::mkl_random-1.0.2-py27hd81d~ --> anaconda::mkl_random-1.0.2-py36hd81dba3_0
  numpy              pkgs/main::numpy-1.15.4-py27h7e9f1db_0 --> anaconda::numpy-1.15.4-py36h7e9f1db_0
  numpy-base         pkgs/main::numpy-base-1.15.4-py27hde5~ --> anaconda::numpy-base-1.15.4-py36hde5b4d6_0
  qt                         pkgs/main::qt-5.9.4-h4e5bff0_0 --> anaconda::qt-4.8.7-2
  tensorflow-base    pkgs/main::tensorflow-base-1.9.0-eige~ --> anaconda::tensorflow-base-1.9.0-gpu_py36h6ecc378_0
  werkzeug                pkgs/main::werkzeug-0.14.1-py27_0 --> anaconda::werkzeug-0.14.1-py36_0

The following packages will be DOWNGRADED:

  astor                                        0.7.1-py27_0 --> 0.7.1-py36_0
  tensorboard                         1.10.0-py27hf484d3e_0 --> 1.9.0-py36hf484d3e_0
  termcolor                                    1.1.0-py27_1 --> 1.1.0-py36_1


Proceed ([y]/n)? y


Downloading and Extracting Packages
tensorflow-gpu-1.9.0 | 2 KB      | ########################################################################################################################################## | 100% 
absl-py-0.7.0        | 156 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
six-1.12.0           | 22 KB     | ########################################################################################################################################## | 100% 
git-2.11.1           | 9.5 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
_tflow_190_select-0. | 2 KB      | ########################################################################################################################################## | 100% 
setuptools-40.6.3    | 625 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
c-ares-1.15.0        | 98 KB     | ########################################################################################################################################## | 100% 
cupti-9.0.176        | 1.6 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
libssh2-1.8.0        | 233 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
gast-0.2.2           | 138 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
ncurses-6.1          | 958 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
protobuf-3.5.2       | 610 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
tensorflow-base-1.9. | 170.8 MB  | ########################################################################################################################################## | 100% 
ca-certificates-2018 | 123 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
python-3.6.8         | 34.4 MB   | ########################################################################################################################################## | 100% 
cudatoolkit-9.0      | 340.4 MB  | ########################################################################################################################################## | 100% 
qt-4.8.7             | 34.1 MB   | ########################################################################################################################################## | 100% 
sqlite-3.26.0        | 1.9 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
astor-0.7.1          | 43 KB     | ########################################################################################################################################## | 100% 
tensorboard-1.9.0    | 3.3 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
mkl_fft-1.0.10       | 170 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
mkl_random-1.0.2     | 407 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
certifi-2018.11.29   | 146 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
wheel-0.32.3         | 35 KB     | ########################################################################################################################################## | 100% 
numpy-base-1.15.4    | 4.3 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
numpy-1.15.4         | 47 KB     | ########################################################################################################################################## | 100% 
curl-7.63.0          | 145 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
openssl-1.1.1        | 5.0 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
tk-8.6.8             | 3.1 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
libedit-3.1.20181209 | 188 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
markdown-3.0.1       | 107 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
werkzeug-0.14.1      | 423 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
krb5-1.16.1          | 1.4 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
termcolor-1.1.0      | 7 KB      | ########################################################################################################################################## | 100% 
pip-18.1             | 1.8 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
libcurl-7.63.0       | 550 KB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
tensorflow-1.9.0     | 3 KB      | ########################################################################################################################################## | 100% 
grpcio-1.16.1        | 1.1 MB    | ########################################################################################################################################## | 100% 
cudnn-7.1.2          | 367.8 MB  | ########################################################################################################################################## | 100% 
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

(好的-我现在看到了对python 3.7的更改,但这仍然是一件令人讨厌的事情,必须谨慎。是否有某种方法可以迫使它离开我的Python版本?)

mer*_*erv 10

原因

在不更新conda软件包的情况下更改Python版本会破坏Conda。。Python版本更改(2.7.14-> 3.6.8)造成了一种情况,即新版本python具有site-packages不再包含conda软件包的新版本,而如果仅在2.7.x内进行更新,则不会有问题。

Conda包含一组二进制文件(例如,conda在shell中键入时要调用的二进制文件)和同名的Python包。Python包对于整个Conda来说是必需的,并且在您尝试使用时都会加载它conda

有问题的是,Anaconda上的许多软件包似乎正在触发Python版本更改,但随后没有触发conda软件包更新。这听起来像是依赖解析器所忽略的东西-即默认行为应该是保护所居住的基本环境的完整性conda

试图恢复

恢复的一种可能方法是暂时使用独立的Build conda-exec修复基本环境。您可以从任何目录执行以下所有操作,因此可以使用临时文件或在任何放置下载的地方进行。如果可行或需要调整,请在评论中报告!

  1. 下载适合您平台的Conda(在此我们将使用conda-latest-linux-64.exe)。不要介意.exe它是二进制文件,应该在外壳程序中运行时运行。conda-exec无论如何,我都会将其重命名为:

    wget -O conda-exec https://repo.anaconda.com/pkgs/misc/conda-execs/conda-latest-linux-64.exe
    chmod +x conda-exec
    
    Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
  2. 暂时设置CONDA_ROOT_PREFIX为您的安装基础。通常是anaconda3or miniconda3文件夹;在这种情况下,我们将使用OP给定的路径:

    export CONDA_ROOT_PREFIX=/home/me/anaconda2
    
    Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
  3. 测试它是否有效:

    ./conda-exec info
    
    Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

    要检查的关键是base environment:正确识别基本环境所在并将其显示为(writable)。你也应该看到pkgs在你的文件夹基地在ENV package cache:

选项1:还原到先前的修订

  1. 在当前版本之前确定版本(我们将<k-1>在此处表示),并尝试将其还原:

    ./conda-exec list -n base --revisions
    ./conda-exec install -n base --revision <k-1>
    
    Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

    如果这可行,则应该完成。启动一个新的外壳,然后conda再次尝试使用。否则,另一个选择是...

选项2:安装conda最新的Python

  1. (重新)将conda软件包安装在基本环境中

    ./conda-exec install -n base conda
    
    Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

    确保建议的Conda构建与当前安装的Python版本相对应。--force-reinstall如果该标志声称已满足要求,则可能会很有用。

尝试一个新的外壳,看看是否conda正常。您不需要保持conda-exec周围。

最后求助

如果其他所有方法均失败,则可能只需要重新安装即可。其他人报告说已安装在其他目录中,并且仍然可以使用和访问其env。

预防措施

通过更好的实践避免破损

首先,只是一般的(自以为是)建议:充分利用虚拟ENVS更多。这并不能直接解决问题,但是可以帮助您拥有一个工作流,该工作流不那么容易遇到此类陷阱。首先你不应该接受这样一个巨大的变化,而不是基地。就个人而言,我很少在基础架构之外的基础上安装东西(emacs,与jupyter相关的东西,conda等)。1 软件包包含在特定于项目的环境中,或者至少在开发类型的环境中。

例如,如果我正在显示安装,我会为此创建一个新的环境

conda create -n tf36 anaconda::tensorflow-gpu python=3.6
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

或您实际希望使用的任何Python版本。

直接解决方案:固定

Conda确实支持软件包固定,这是一种更直接的方法,可确保您不再将Python 2转换为3从而再次破坏基础安装。即,在env的conda-meta文件夹中创建一个文件,pinned并添加以下行

python 2.7.*
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

请注意,有些用户报告了3.6-> 3.7过渡的类似问题,因此我认为此处必须包含次要版本。请参阅有关固定的文档


[1]请注意,我使用的是Miniconda,而不是Anaconda安装程序,因此从一开始我就对基础有了更多的控制。

  • 我想确认在3.6-&gt; 3.7转换中面临相同的问题。 (9认同)
  • 感谢您的解释。我无法正确恢复,实际上不得不从头开始删除并重新安装Anaconda。只是通过执行“ conda update --all”就可以发生此问题,而没有任何警告。 (2认同)
  • @Mastiff 一般来说,不建议就地升级Python版本(除了补丁之外)。它几乎没有任何意义,因为它会触发几乎每个包都需要新的构建。只需创建一个新环境即可。另外,我强烈建议所有用户不要使用他们的 **base** 环境进行工作,因此其中的 Python 版本应该无关紧要。 (2认同)