如何在 MPI 代码上从 gprof 获得有意义的结果？

Question

我正在优化 MPI 代码并且正在使用 Gprof。问题是我得到的结果完全不合理。我的工作流程如下：

• 编译代码添加-pg为编译标志。

• 运行代码mpirun -np Nproc EXEC.exe arg1 ... argN。

• 在可执行文件上运行 gprof gprof EXEC.exe

这有什么问题？

Answer 1

运行指令gprof通常假定程序是串行的，或单进程但多线程的。

要运行gprof像 MPI 程序这样的多进程程序，您需要

1. 确保每个进程输出自己的文件
2. 跨进程显式求和文件
3. 运行gprof结果。

这篇博文或LLNL 的这些说明是很好的起点：

1. 在运行 mpiexec 命令之前设置记录不足的GMON_OUT_PREFIX环境变量，例如在 bash 中export GMON_OUT_PREFIX=gmon.out-（然后，根据环境，您可能必须运行mpirun -x GMON_OUT_PREFIX -np Nproc EXEC.exe arg1 ... argN以确保每个进程都具有环境变量）
2. 使用 gprof 本身来收集和总结结果， gprof -s EXEC.exe gmon.out-*
3. gprof EXEC.exe gmon.sum（或仅检查单个文件，或使用gprof EXEC.exe gmon.out-12345或共同检查文件gprof EXEC.exe gmon.out-*）