使用 gcc 编译 cython：#include "ios" 中没有这样的文件或目录

Question

给定一个docprep.pyx简单的文件

from spacy.structs cimport TokenC

print("loading")

并试图通过

cythonize -3 -i docprep.pyx

我收到以下错误消息

docprep.c:613:10: fatal error: ios: No such file or directory
 #include "ios"
          ^~~~~
compilation terminated

从路径中可以看出，该系统安装了 Python 3.7 的 Anaconda。numpy，spacy并且cython都是通过conda.

Answer 1

在我的情况下，它使用@mountrix 提示工作，只需将其添加language="c++"到您的 setup.py 中，例如：

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Build import cythonize
import numpy


extensions = [
    Extension("processing_module", sources=["processing_module.pyx"], include_dirs=[numpy.get_include()], extra_compile_args=["-O3"], language="c++")
]

setup(
    name="processing_module",
    ext_modules = cythonize(extensions),
)

Answer 2

<ios>是一个 c++ 头文件。错误消息显示您尝试将 C++ 代码编译为 C 代码。

默认情况下，Cython 将生成一个扩展名为 的文件，*.c稍后编译器会将其解释为 C 代码。

Cython 还可以为 C++ 生成具有正确文件扩展名的文件，即*.cpp. 并且有多种方法可以触发这种行为：

• # distutils: language = c++在pyx-file的开头添加。
• 添加language="c++"到-file 中的Extension定义setup.py。
• 调用cython选项--cplus。
• 在 IPython 中，用 调用%%cython魔法-+，即%%cython -+。
• 有关使用 构建时的替代方案pyximport，请参阅此 SO-question。

实际上，因为cythonize没有命令行选项来触发 c++-generation，因此第一个选项看起来是最好的方法：

# distutils: language = c++

from spacy.structs cimport TokenC
print("loading") 

问题是spacy/structs.pxd 使用 c++-constructs，例如向量或任何其他 cimported from libcpp：

...
from libcpp.vector cimport vector
...

因此，构建还需要 c++-libraries/headers。