使用snakemake打印简化的DAG图

Question

我有一个很长的snakemake工作流程，它处理带有许多并行规则的9个样本。当我使用以下命令为DAG创建图片时：

snakemake --forceall --dag | dot -Tpdf > dag.pdf

产生的dag图非常庞大且非常多余（并且由于节点放置复杂而很难看）。

是否可以生成一个标准的dag图，该图不会显示每个任务的9个节点，而仅显示所有步骤的主要路径？

我以为可以将示例列表简化为一个示例，但是希望有一种更好的方法而不触动蛇文件（秘密参数？）

谢谢

Answer 1

使用标志--rulegraph代替--dag。