Sweave v. Knitr v. Rmarkdown：代码块头

Question

我试图了解rmarkdown,sweave和knitr。查看代码和示例我遇到了两种类型的代码头，我不明白它们属于什么语言/包。

标题是

```{}
```

和

<<>>=
@

1. 它们之间有什么区别？
2. 他们与什么有关rmarkdown，sweave以及knitr? 有什么？
3. 如果我在一个.rnw，我使用的是哪个？

Answer 1

sweave 和 rmarkdown 都提供了为 R、python 和其他编程语言运行任意代码的能力。每种方法的优缺点各不相同，但可以快速比较：

R降价：

• 典型的文件扩展名：.rmd（case-insens），也许.rmarkdown

• 支持 R、python 和其他几种语言

• 输出为 HTML、docx、LaTeX（以及 PDF）和其他几种输出格式

• 使用三重反引号进行块划分

    Regular text.
  
    ```{r chunkname, chunkoptions, ...}
    a <- 1
    ```
  
    ```{python pychunk, chunkoptions, ...}
        def myfun(v: list) -> list:
        """
        Something important in this docstring.
        """
        return [a+1 for a in v]
    ```
  
    More regular text.
  

• 因为是基于markdown的，所以在交叉引用、table-control等方面有一定的限制；其中许多都有软件包和已知的缓解技术（太多了，无法在此列出）。但是，您可以在 Markdown 中直接使用 LaTeX 格式，因此输出到 PDF 也可以享受这种控制（尽管 LaTeX 代码不会转换为其他输出格式）。

编织：

• 典型的文件扩展名包括.rnw(case-insens) 和我见过的.noweb（对此不完全确定......）

• 支持 R，如果您可以通过 R（例如 via reticulate）访问它们，则可能还支持其他语言

• 输出到 LaTeX 和 PDF

• 使用<<>>=和@为大块划分：

    Regular text.
  
    <<chunkname, chunkoptions, ...>>=
    a <- 1
    @
  
    More regular text.
  

• 因为它直接基于 LaTeX，所以您可以尽可能多地控制格式、交叉引用等

knitr

• 处理sweave和rmarkdown格式的文件
• 可能需要一些编织预处理（例如，使用Sweave2knitr），参考：https : //yihui.name/knitr/demo/sweave/
• knitr的基本原理是“解决 Sweave 中的一些长期存在的问题，并将其他附加包中的功能合并到一个包中（knitr ? Sweave + cacheSweave + pgfSweave + weaver + animation::saveLatex + R2HTML::RweaveHTML + highlight ::HighlightWeaveLatex + 0.2 * brew + 0.1 * SweaveListingUtils + 更多）。”