5 python matlab curve-fitting sympy scipy
我有一些数据想要使用二阶、三阶或四阶傅立叶级数进行拟合。
虽然关于堆栈溢出的这个问题和答案接近我想要使用 scipy 做的事情,但他们已经将系数预先定义为 tau = 0.045 。我希望我的拟合能够找到具有 95% 置信区间的可能系数(a0、w1、w2、w3 等),就像傅里叶级数的MATLAB 曲线拟合等效项一样。我看到的另一个选项是使用sympy 中的 fourier_series,但是该函数仅适用于适合定义函数的符号参数,而不适用于原始数据。
1)有没有办法让 sympy fourier_series 接受原始数据而不是函数或使用该库的其他解决方法?
2)或者考虑到存在多个未知数(系数),对数据进行 scipy 曲线拟合
如果您愿意,您可以sympy使用我为此目的编写的名为symfit. 它基本上scipy使用sympy接口进行包装。使用symfit,您可以执行如下操作:
from symfit import parameters, variables, sin, cos, Fit
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
def fourier_series(x, f, n=0):
"""
Returns a symbolic fourier series of order `n`.
:param n: Order of the fourier series.
:param x: Independent variable
:param f: Frequency of the fourier series
"""
# Make the parameter objects for all the terms
a0, *cos_a = parameters(','.join(['a{}'.format(i) for i in range(0, n + 1)]))
sin_b = parameters(','.join(['b{}'.format(i) for i in range(1, n + 1)]))
# Construct the series
series = a0 + sum(ai * cos(i * f * x) + bi * sin(i * f * x)
for i, (ai, bi) in enumerate(zip(cos_a, sin_b), start=1))
return series
x, y = variables('x, y')
w, = parameters('w')
model_dict = {y: fourier_series(x, f=w, n=3)}
print(model_dict)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这将打印我们想要的符号模型:
{y: a0 + a1*cos(w*x) + a2*cos(2*w*x) + a3*cos(3*w*x) + b1*sin(w*x) + b2*sin(2*w*x) + b3*sin(3*w*x)}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
接下来,我将把它拟合到一个简单的步骤函数中,以向您展示它是如何工作的:
# Make step function data
xdata = np.linspace(-np.pi, np.pi)
ydata = np.zeros_like(xdata)
ydata[xdata > 0] = 1
# Define a Fit object for this model and data
fit = Fit(model_dict, x=xdata, y=ydata)
fit_result = fit.execute()
print(fit_result)
# Plot the result
plt.plot(xdata, ydata)
plt.plot(xdata, fit.model(x=xdata, **fit_result.params).y, color='green', ls=':')
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
这将打印:
Parameter Value Standard Deviation
a0 5.000000e-01 2.075395e-02
a1 -4.903805e-12 3.277426e-02
a2 5.325068e-12 3.197889e-02
a3 -4.857033e-12 3.080979e-02
b1 6.267589e-01 2.546980e-02
b2 1.986491e-02 2.637273e-02
b3 1.846406e-01 2.725019e-02
w 8.671471e-01 3.132108e-02
Fitting status message: Optimization terminated successfully.
Number of iterations: 44
Regression Coefficient: 0.9401712713086535
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
并产生以下图:
就是这么简单!剩下的我就留给你们想象吧。有关详细信息,您可以在此处找到文档。