Python IOError: [Errno 5] 输入/输出错误？

Question

我在远程服务器上运行一个使用 nohup 的 python 脚本。

• 首先，我使用 VPN 和 SSH 连接到远程机器

• 其次，我使用以下命令运行 python 脚本：

  nohup python backmap.py mpirun -np 48 &

python 脚本包含以下几行：

frame = []
file_in = open("Traj_equil_prot.pdb", "r")
for line in file_in:
    if line.startswith('TITLE'):
        frame.append(line[127:134])

import os
for fileNum in range(631, 29969):
    os.system("./initram-v5.sh -f Traj_equil_prot_frame" +  str(fileNum) + ".pdb -o Traj_equilprot_aa_frame" + str(frame[fileNum]) + ".gro -to amber -p topol.top")

脚本一整天都运行得很好。但现在它刚刚崩溃，当我再次尝试重新启动它时，出现以下错误：

回溯（最近一次调用最后一次）：文件“”，第 1 行，在 IOError 中：[Errno 5] 输入/输出错误

该文件位于工作目录中。我尝试再次断开/连接，但仍然是同样的问题。我不知道我错过了什么。请问有什么帮助吗？

Answer 1

我遇到了同样的问题，我曾经使用以下命令运行我的脚本：

python MY_SCRIPT.py &

该脚本将在后台运行，输出将显示在终端上，直到您注销或退出。

通过注销，脚本仍在运行，但它的输出无处显示，因此，当脚本想要显示某些内容（例如调用print）时，将产生异常。

解决方案：

我已将输出通过管道传输到实际终端显示以外的其他地方：

python MY_SCRIPT.py >/dev/null &

查看此链接了解更多详情：

/sf/answers/2676679701/

Answer 2

我最终通过打开文件“file_in”、修改它（例如，仅在备注行中添加一个点）并保存更改来解决了问题。