sta*_*ant 12 r domc progress-bar parallel-foreach
使用foreach和doMC后端使用"多核"并行性时(我使用doMC时,我调查了其他包不允许从我想要获取进度条,使用进度包,但任何进度)这适用于Linux终端,即没有tcltk弹出窗口).
鉴于它使用分叉,我可以想象它可能不可能,但我不确定.
预期用途是指示并行加载连接100个文件时的进度(通常在#!Rscript中)
我看过几个帖子,比如在R中使用"foreach()"函数时如何创建进度条?.很高兴为此奖励.
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为有人向我展示500分的赏金
Reprex
# load packages
library("futile.logger")
library("data.table")
library("foreach")
# create temp dir
tmp_dir <- tempdir()
# create names for 200 files to be created
nb_files <- 200L
file_names <- file.path(tmp_dir, sprintf("file_%s.txt", 1:nb_files))
# make it reproducible
set.seed(1L)
nb_rows <- 1000L
nb_columns <- 10L
# create those 200 files sequentially
foreach(file_i = file_names) %do%
{
DT <- as.data.table(matrix(data = runif(n = nb_rows * nb_columns), nrow = nb_rows))
fwrite(x = DT, file = file_i)
flog.info("Creating file %s", file_i)
} -> tmp
# Load back the files
foreach(file_i = file_names, .final = rbindlist) %dopar%
{
flog.info("Loading file %s", file_i)
# >>> SOME PROGRESS BAR HERE <<<
fread(file_i)
} -> final_data
# show data
final_data
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
期望的输出
请注意,进度条不会与打印行混淆)
INFO [2018-07-18 19:03:48] Loading file /tmp/RtmpB13Tko/file_197.txt
INFO [2018-07-18 19:03:48] Loading file /tmp/RtmpB13Tko/file_198.txt
INFO [2018-07-18 19:03:48] Loading file /tmp/RtmpB13Tko/file_199.txt
INFO [2018-07-18 19:03:48] Loading file /tmp/RtmpB13Tko/file_200.txt
[ =======> ] 4%
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
编辑2
在赏金结束后,没有什么能接近预期的结果.
在进度条中记录会使一切变得混乱.如果有人得到了正确的结果,我会给出另一个基于结果的赏金.