在Rcpp中，如何将用户定义的结构从C转换为R

Question

我正在使用Rcpp软件包，并且可以让我的C函数在R中编译和运行，但是现在我想将一个大型的，用户定义的数据结构返回给R。该结构中的字段是数字或字符串-没有新的或奇数类型在结构内。下面的示例已简化并且未编译，但传达了我的问题的想法。

    typedef struct {
        char*   firstname[128];
        char*   lastname[128];
        int      nbrOfSamples;
    } HEADER_INFO;

    // [[Rcpp::export]]
    HEADER_INFO* read_header(Rcpp::StringVector strings) {
        FILE *fp;
        MEF_HEADER_INFO *header;

        char * filename = (char*)(strings(0));
        char * password = (char*)(strings(1));

        header = (HEADER_INFO*)malloc(sizeof(HEADER_INFO));
        memset(header, 0, sizeof(HEADER_INFO));

        fp = fopen(filename, "r");
        (void)read_header(header, password);
        return header;
    }

我很确定可以将标头中的条目打包回到StringVector中，但这似乎是一种蛮力的方法。我的问题是是否存在更优雅的解决方案。我不清楚这种结构在R：命名列表中将具有什么样的形式？

谢谢！

Answer 1

R中正确的结构取决于您的实际struct外观。命名列表是最通用的列表。这里是wrap注释中提到的函数的简单示例实现：

#include <RcppCommon.h>

typedef struct {
  char*   firstname[128];
  char*   lastname[128];
  int      nbrOfSamples;
} HEADER_INFO;

namespace Rcpp {
  template <>
  SEXP wrap(const HEADER_INFO& x);
}

#include <Rcpp.h>

namespace Rcpp {
  template <>
  SEXP wrap(const HEADER_INFO& x) {
    Rcpp::CharacterVector firstname(x.firstname, x.firstname + x.nbrOfSamples);
    Rcpp::CharacterVector lastname(x.lastname, x.lastname + x.nbrOfSamples);
    return Rcpp::wrap(Rcpp::List::create(Rcpp::Named("firstname") = firstname,
                      Rcpp::Named("lastname") = lastname,
                      Rcpp::Named("nbrOfSamples") = Rcpp::wrap(x.nbrOfSamples)));
  };
}

//  [[Rcpp::export]]
HEADER_INFO getHeaderInfo() {
  HEADER_INFO header;
  header.firstname[0] = (char*)"Albert";
  header.lastname[0] = (char*)"Einstein";
  header.firstname[1] = (char*)"Niels";
  header.lastname[1] = (char*)"Bohr";
  header.firstname[2] = (char*)"Werner";
  header.lastname[2] = (char*)"Heisenberg";
  header.nbrOfSamples = 3;
  return header;
}

/*** R
getHeaderInfo()
 */

输出：

> getHeaderInfo()
$firstname
[1] "Albert" "Niels"   "Werner"

$lastname
[1] "Einstein"   "Bohr"       "Heisenberg"

$nbrOfSamples
[1] 3

但是，对于这种特殊情况，使用起来data.frame会更自然，这可以通过在上面替换wrap为：

  template <>
  SEXP wrap(const HEADER_INFO& x) {
    Rcpp::CharacterVector firstname(x.firstname, x.firstname + x.nbrOfSamples);
    Rcpp::CharacterVector lastname(x.lastname, x.lastname + x.nbrOfSamples);
    return Rcpp::wrap(Rcpp::DataFrame::create(Rcpp::Named("firstname") = firstname,
                                              Rcpp::Named("lastname") = lastname));
  };

输出：

> getHeaderInfo()
  firstname   lastname
1    Albert   Einstein
2     Niels       Bohr
3    Werner Heisenberg