R Markdown:如何使RStudio显示内联而不是新窗口的Python图？

Question

所以,我最后一直广泛使用R Markdown,我对它的功能非常满意.

但是,我遇到了python图的问题.我有一大块python代码,我在python中绘制多个数字.

当我使用R执行此操作时,RStudio将显示此块中生成的所有绘图并排.

不幸的是,当用一大块python代码做同样的事情时,RStudio会打开一个新窗口显示图表,然后代码执行停止,直到我关闭该窗口,然后它绘制下一个图,我必须再次关闭它,等等

是否有可能强制RStudio将数字内联,然后继续执行代码？感谢您的帮助!

Answer 1

为了扩展我之前的评论,我将详细说明一个完整的答案.使用时matplotlib,使用Qt渲染绘图,这就是您获得弹出窗口的原因.

如果我们使用fig.savefig而不是pyplot.show然后pyplot.close我们可以避免弹出窗口.这是一个最小的例子:

---
output: html_document
---

## Python *pyplot*

```{python pyplot, echo=FALSE}
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

t = np.arange(0.0, 2.0, 0.01)
s = 1 + np.sin(2 * np.pi * t)

fig, ax = plt.subplots()
ax.plot(t, s)

ax.set(xlabel='time (s)', ylabel='voltage (mV)',
       title='About as simple as it gets, folks')
ax.grid()

fig.savefig("pyplot.png")
plt.close(fig)
```

```{r, echo=FALSE}
knitr::include_graphics("pyplot.png")
```

在没有任何进程中断的情况下生成以下内容:

资料来源:matplotlib.org

NB根据RStudio v1.2.679-1 Preview 的发行说明,此版本将显示Python块发出的matplotlib图.

更新

使用上面提到的最新预览版,更新要使用的块pyplot.show现在将根据需要显示内联.

```{python pyplot, echo=FALSE}
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

t = np.arange(0.0, 2.0, 0.01)
s = 1 + np.sin(2 * np.pi * t)

fig, ax = plt.subplots()
ax.plot(t, s)

ax.set(xlabel='time (s)', ylabel='voltage (mV)',
       title='About as simple as it gets, folks')
ax.grid()

plt.show()
```

对于Anaconda用户

如果您使用Anaconda作为您的python发行版,您可能会遇到一个问题,即由于缺少路径/环境变量的问题而无法从RStudio找到Qt.

该错误将类似于:

此应用程序无法启动,因为它无法在""中找到或加载Qt平台插件"windows",重新安装应用程序可能会解决此问题.

快速解决方法是将以下内容添加到python块以设置环境变量.

import os
os.environ['QT_QPA_PLATFORM_PLUGIN_PATH'] = '/path/to/Anaconda3/Library/plugins/platforms'

/path/to将相关位置替换为您的Anaconda发行版.