无法更改网状（R）中的python路径

Question

启动rstudio会话时运行的第一行是：

library(reticulate)
use_python("/usr/local/lib/python3.6/site-packages")

但是，当我运行py_config()它时，显示仍在使用默认的python 2.7安装。

这是一个问题，因为我无法导入已为python3安装的任何模块。知道为什么这行不通吗？我非常仔细地遵循了文档。

Answer 1

它对我有用：

Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON = "/usr/bin/python3")
library(reticulate)

在第一次使用 reticulate 之前设置 RETICULATE_PYTHON 似乎很重要。

Answer 2

我观察到.RProfile中的“ use_python（'path'）”技术和Sys.setenv（RETICULATE_PYTHON ='path'）的策略对我来说都不起作用（当然，我确信它必须对其他人也有用。）

无论如何，终端上的线路

which -a python python3

确实产生了两个可供选择的路径（一个用于python2，一个用于在我的mac上安装的python3），因此我能够在主目录中创建一个“ .Renviron”文件，其中只有以下一行：

RETICULATE_PYTHON="/usr/local/bin/python3"

重新启动RStudio之后，library(reticulate)激活所需的python3，并repl_python()打开python3交互式窗口，等等。

Answer 3

use_python("path/to/python3")肯定不行，虽然Reticulate Python 版本配置文章是这么说的。不信！:-)

我尝试使用当前的 Reticulate 版本 (1.13) 设置解释器，并且该软件包给了我一个非常诚实的答案：

> library("reticulate")
> repl_python()
Python 2.7.15 (/usr/bin/python)
Reticulate 1.13 REPL -- A Python interpreter in R.
> use_python('/usr/bin/python3', require=T)
ERROR: The requested version of Python ('/usr/bin/python3') cannot be
used, as another version of Python ('/usr/bin/python') has already been
initialized. Please restart the R session if you need to attach
reticulate to a different version of Python.
Error in use_python("/usr/bin/python3", require = T) : 
  failed to initialize requested version of Python

幸运的是，将.Renviron包含该行的文件RETICULATE_PYTHON="/path/to/python3"放入用户的主目录确实有效：

> library("reticulate")
> py_config()
python:         /usr/bin/python3
libpython:      /usr/lib/python3.6/config-3.6m-x86_64-linux-gnu/libpython3.6.so
pythonhome:     /usr:/usr
version:        3.6.8 (default, Oct  7 2019, 12:59:55)  [GCC 8.3.0]
numpy:           [NOT FOUND]

NOTE: Python version was forced by RETICULATE_PYTHON

最后，这是我的答案的附加值：

您可以通过将RETICULATE_PYTHON行添加到全局Renviron文件来为所有用户配置 Reticulate Python 解释器。它通常位于etcR 主目录的子目录中。您可以通过R.home()在 R 解释器中运行该函数来找出 R 的家在哪里。在我的情况下（Ubuntu 18.04.3 LTS）它是/usr/lib/R，所以我编辑了/usr/lib/R/etc/Renviron. 您显然需要管理员权限才能执行此操作。

Answer 4

在 Mac OSX 上唯一对我有用的是在终端中执行以下命令：

touch $HOME/.Renviron

然后打开它，我使用vim，所以我的命令如下：

vim $HOME/.Renviron

添加以下内容（对于 anaconda）：

RETICULATE_PYTHON="/anaconda3/bin/python"

否则，在终端中输入：which python3并输入您的输出路径

RETICULATE_PYTHON="your path from which python3"