如何在熊猫数据框中对接近重复的值进行分组？

Question

如果 DataFrame 中有重复值，pandas 已经提供了替换或删除重复值的功能。另一方面，在许多实验数据集中，一个人可能有“接近”的重复。

如何将这些接近重复的值替换为例如它们的平均值？

示例数据如下所示：

df = pd.DataFrame({'x': [1, 2,2.01, 3, 4,4.1,3.95, 5,], 
                   'y': [1, 2,2.2, 3, 4.1,4.4,4.01, 5.5]})

我试图将一些东西拼凑在一起，将接近重复的东西放在一起，但这正在使用 for 循环，似乎是对熊猫的一种黑客攻击：

def cluster_near_values(df, colname_to_cluster, bin_size=0.1):

    used_x = [] # list of values already grouped
    group_index = 0
    for search_value in df[colname_to_cluster]:

        if search_value in used_x:
            # value is already in a group, skip to next
            continue

        g_ix = df[abs(df[colname_to_cluster]-search_value) < bin_size].index
        used_x.extend(df.loc[g_ix, colname_to_cluster])
        df.loc[g_ix, 'cluster_group'] = group_index
       group_index += 1

    return df.groupby('cluster_group').mean()

其中分组和平均：

print(cluster_near_values(df, 'x', 0.1))

                  x     y
cluster_group                
0.0            1.000000  1.00
1.0            2.005000  2.10
2.0            3.000000  3.00
3.0            4.016667  4.17
4.0            5.000000  5.50

有没有更好的方法来实现这一目标？

Answer 1

下面是一个示例，您希望将项目分组到一位精度。您可以根据需要修改它。您还可以针对阈值超过 1 的分箱值修改此设置。

df.groupby(np.ceil(df['x'] * 10) // 10).mean()    
            x     y
x                  
1.0  1.000000  1.00
2.0  2.005000  2.10
3.0  3.000000  3.00
4.0  4.016667  4.17
5.0  5.000000  5.50