循环中的rmarkdown :: render() - 无法分配大小的向量

Question

我有一堆目录与Rmd文件编译成HTML.每个电话都rmarkdown::render包含一个大的列表params.当我单独渲染Rmd文件时,一切正常.

但是,当我执行一个循环遍历目录并构建HTML文件的函数时,它会在完成九个文件后崩溃(它不是导致问题的特定Rmd,它会在9日崩溃而不管顺序如何).

错误回溯的相关部分是:

Error: cannot allocate vector of size 38.4 Gb

8. knitr::knit_meta_add(old_knit_meta, attr(old_knit_meta, "knit_meta_id")) 

7. rmarkdown::render(input = RMDfile, output_file = RMDfileout, 
        output_format = output, output_dir = dir, param = params, 
        quiet = quiet)

该问题似乎是由以下行引起的rmarkdown::render:

 on.exit({
    knit_meta_reset()
    if (length(old_knit_meta)) {
      knitr::knit_meta_add(old_knit_meta, attr(old_knit_meta, 
                                               "knit_meta_id"))
    }
  }, add = TRUE)

在我看来,params之前的调用正在保存在元数据中,并且rmarkdown::render在函数中调用9次之后变得太大了.

rmarkdown::knitr有一个knit_meta参数,但帮助文档说" (专家使用)由knitr生成的元数据 ",我不是knitr专家.

Rmd文件完全相互独立.有没有办法重置每次调用的knitr元数据rmarkdown::render？

我希望有人能为此提供快速修复或解决方法.如果没有,我将开发一个例子来重现问题.

Answer 1

在rmarkdown::render代码中挖掘了一段时间后,我找到了解决方案.

添加knitr::knit_meta(class=NULL, clean = TRUE)之前rmarkdown::render(input=file, etc)似乎做了伎俩..