如何使用GDB在Emacs中调试R包(带C代码)？

Question

我目前正在编写一个R包,并通过R中的包使用已编译的C++代码Rcpp(Rcpp使得像我这样的非程序员,恕我直言的R和C++代码的交互更容易).

我想使用gdb在我的C++程序中调试一些错误.我用google搜索了一下,主要是在emacs,R-FAQ,这里的一些邮件,以及R的Writing R Extension手册中调试R的一些资源.

但是,我这是第一次这样做,我不能走得太远.任何人都可以给我一些关于如何在emacs中调试R包(或带有C++/C代码的扩展)的指针.具体来说,我想利用ESS与R和gdb一起使用Emacs(如R-FAQ所述).

请注意,我对如何仅使用C或C++程序使用gdb感到满意.但我无法将这些知识转化为使用带有R和扩展名的gdb.

Answer 1

您可以使用RInside(Rcpp的一个很好的伴侣)将问题转化为纯C++开发和调试任务,从而利用您现有的调试C++程序的知识.

编写一个main()使用RInside创建R实例的C++函数,执行设置测试用例的R代码(或源R脚本),然后从main()调用测试中的函数,例如

#include <Rcpp.h>
#include <RInside.h>
#include "function_under_test.h"

int main(int argc, char *argv[]) 
{
    using namespace std;
    using namespace Rcpp;

    RInside R(argc, argv);

    string evalstr = R"(
        a <- matrix(c(1,1,1, 1,1,1, 1,1,1), nrow = 3, ncol=3)
    )";
    R.parseEvalQ(evalstr);

    SEXP a = R["a"];

    R["b"] = function_under_test(a);

    evalstr = R"(
        print(b)
    )";
    R.parseEvalQ(evalstr);

    return 0;
}

然后像往常一样通过设置断点function_under_test()等来调试带有gdb的C++程序.

这样您就可以避免在R和C++开发环境之间切换,并且必须重新安装R包.

Answer 2

不幸的是，这并不那么容易。你需要在 ESS、gdb（即 Emacs 中的 gud）和 R 之间跳转。最好的描述可能仍然是 win 编写 R 扩展，但是ESS 邮件列表上最近有一个线程也讨论了这个问题（请注意，有些回复来自在线程之外，所以也请查看邮件列表存档）。