Rstudio中的未知图形设备错误

Question

我想将10个不同的ggplots参数保存到具有不同参数的光盘，但出现错误：

错误：未知的图形设备''

这是我的代码：

for (geneNum in 1:10) {
  geneCounts <- plotCounts(dds, gene=gene_list[geneNum], 
  intgroup=c("Groups","Mouse"), returnData=TRUE)
  ggplot(geneCounts, aes(x=Mouse, y=count, color=Groups, 
  group=Groups)) +
  scale_y_log10() + geom_point(size=3) + geom_line() + 
  ggtitle(gene_list[geneNum])
  filename <- paste0("gene", geneNum, sep="_")
  ggsave(filename,
     plot = last_plot(), # or give ggplot object name as in myPlot,
     width = 5, height = 5,
     units = "in", # other options c("in", "cm", "mm"), 
     dpi = 300)
}

任何建议将不胜感激。

Answer 1

（摘自Alistaire的评论。）

ggsave()在文件名上查找文件扩展名，例如.png，并使用适当的（R称为）图形设备保存图像（实际上是用于对图像数据进行编码的系统，PNG，BMP，JPG，PDF等）。 。此错误通常是由文件名中缺少或不正确的文件扩展名引起的。具体来说，在您的情况下，

更改

filename <- paste0("gene", geneNum, sep="_")

例如（用于.png输出）：

filename <- paste0("gene", geneNum, ".png", sep="_")