Ric*_*her 5 plot r ggplot2 ggtern
我在R中使用ggtern绘制三元图,并希望在ggtern图上具有轴标签和断点,与原始数据相同。对于以下代码中生成的数据,每个轴的最大值为12、10和4。
在上一篇文章之后,我尝试使用中断和标签来执行此操作,但是每个轴仍在0-1比例尺上,缺少标签(由于它们超过1),并且带有标签的轴线不与点相交在情节上。(如何更改ggtern制作的三元图的标签?)
library(ggtern)
labFnc <- function(x,digits=2) format(round(unique(x),digits),digits=digits)
mydata <- data.frame(
x = runif(50, min = 0.25, max = 12),
y = runif(50, min = 0.1, max = 10),
z = runif(50, min = 0.5, max = 4),
value = runif(50, min = 10000, max = 20000))
ggtern(data = mydata,aes(x = x, y = y, z = z,col=value)) +
theme_bw() +
geom_point(alpha = 0.8, size = 3) +
theme_showarrows() +
scale_T_continuous(breaks=unique(mydata$x),labels=labFnc(mydata$x))+
scale_L_continuous(breaks=unique(mydata$y),labels=labFnc(mydata$y))+
scale_R_continuous(breaks=unique(mydata$z),labels=labFnc(mydata$z))
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有没有办法做到这一点?任何帮助将不胜感激。
编辑:我也尝试添加tern_limits参数。虽然这看起来会按比例扩大绘图,但数据放置在错误的位置。而且我无法像以前一样添加自己的独特休息时间。
ggtern(data = mydata,aes(x = x, y = y, z = z,col=value)) +
theme_bw() +
geom_point(alpha = 0.8, size = 3) +
theme_showarrows() +
tern_limits(T=12, L=10, R=4)
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您提供的解决方案是正确的,但是,limit_term(...)
函数(或别名)的所有参数都应在 [0,1] 范围内,对应于 [0,100%]。可以提供超出此范围的值,但是,这将用于解决包含大于 100% 和小于 0% 的值的限制。
总之,使用以下内容:
tern_limits(T=12, L=10, R=4)
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实际上是要求三元限制分别受 1200%、1000% 和 400% 最大值的约束,这与您尝试的结果完全一致。
不管怎样,这里有一些limits_tern
和zoom
功能的例子。
library(ggtern)
n = 100
df = data.frame(id=1:n,
x=runif(n),
y=runif(n),
z=runif(n))
base = ggtern(df,aes(x,y,z,color=id)) + geom_point(size=3)
base
#Top Corner
base + limit_tern(1.0,0.5,0.5)
#Left Corner
base + limit_tern(0.5,1.0,0.5)
#Right Corner
base + limit_tern(0.5,0.5,1.0)
#Center Zoom Convenience Function
base + theme_zoom_center(0.4) # Zoom In
base + theme_zoom_center(0.6) # Zoom In
base + theme_zoom_center(0.8) # Zoom In
base + theme_zoom_center(1.0) ##Default as per no zoom
base + theme_zoom_center(1.2) # Zoom Out
base + theme_zoom_center(1.4) # Zoom Out
base + theme_zoom_center(1.6) # Zoom Out
base + theme_zoom_center(1.8) # Zoom Out
base + theme_zoom_center(2.0) # Zoom Out
#Left Zoom Convenience Function
# (try theme_zoom_R and theme_zoom_T for Right and Top respectively)
base + theme_zoom_L(0.4) # Zoom In
base + theme_zoom_L(0.6) # Zoom In
base + theme_zoom_L(0.8) # Zoom In
base + theme_zoom_L(1.0) ##Default as per no zoom
base + theme_zoom_L(1.2) # Zoom Out
base + theme_zoom_L(1.4) # Zoom Out
base + theme_zoom_L(1.6) # Zoom Out
base + theme_zoom_L(1.8) # Zoom Out
base + theme_zoom_L(2.0) # Zoom Out
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注意:这些都是方便的功能,使缩放比通过 scale_X_continuous(...) [X = T,L,R] 独立控制限制(这是有效的)更容易。与 x 和 y 独立的纯笛卡尔坐标系不同,在三元系统中,限制必须有意义,以便三个顶点满足单纯形的条件。
如果您必须独立控制每个轴,下面是一个示例,其中分别为 T、L 和 R 轴定义了每个限制、轴中断和轴标签。如果限制在单纯形条件方面是无意义的,则会引发错误。
ggtern() +
scale_T_continuous(limits=c(0.5,1.0),
breaks=seq(0,1,by=0.1),
labels=LETTERS[1:11]) +
scale_L_continuous(limits=c(0.0,0.5),
breaks=seq(0,1,by=0.1),
labels=LETTERS[1:11]) +
scale_R_continuous(limits=c(0.0,0.5),
breaks=seq(0,1,by=0.1),
labels=LETTERS[1:11])
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