Matplotlib和Networkx-绘制自循环节点

Question

我有这个功能，我想画一个自我循环。我怎样才能做到这一点？
边缘存在，但我认为在这个示例中只有一点（1,1），我无法添加节点的名称。我的目标是从邻接矩阵绘制图形。有没有更好的方法可以做到这一点？

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.patches import FancyArrowPatch, Circle
import numpy as np

def draw_network(G,pos,ax,sg=None):

    for n in G:
        c=Circle(pos[n],radius=0.05,alpha=0.7)
        ax.add_patch(c)
        G.node[n]['patch']=c
        x,y=pos[n]
    seen={}
    for (u,v,d) in G.edges(data=True):
        n1=G.node[u]['patch']
        n2=G.node[v]['patch']
        rad=0.1
        if (u,v) in seen:
            rad=seen.get((u,v))
            rad=(rad+np.sign(rad)*0.1)*-1
        alpha=0.5
        color='k'

        e = FancyArrowPatch(n1.center,n2.center,patchA=n1,patchB=n2,
                            arrowstyle='-|>',
                            connectionstyle='arc3,rad=%s'%rad,
                            mutation_scale=10.0,
                            lw=2,
                            alpha=alpha,
                            color=color)
        seen[(u,v)]=rad
        ax.add_patch(e)
    return e


G=nx.MultiDiGraph([(1,2),(1,1),(1,2),(2,3),(3,4),(2,4),
                (1,2),(1,2),(1,2),(2,3),(3,4),(2,4)]
                )

pos=nx.spring_layout(G)
ax=plt.gca()
draw_network(G,pos,ax)
ax.autoscale()
plt.axis('equal')
plt.axis('off')

plt.show()

Answer 1

使用matplotlib似乎您的方法相当先进，但是我仍然建议使用专门的图形绘图库（networkx文档也是如此（随着图形变大，会出现更多问题-但是已经解决了一些问题）这些图书馆。

graphviz是“ go-to”选项，可以合理地处理多张图形。您可以从networkx图形中写入点文件，然后使用图形绘图工具之一（例如，点，neato等）。

这是一个基于图属性和多图边属性的示例：

import networkx as nx
from networkx.drawing.nx_agraph import to_agraph 

# define the graph as per your question
G=nx.MultiDiGraph([(1,2),(1,1),(1,2),(2,3),(3,4),(2,4), 
    (1,2),(1,2),(1,2),(2,3),(3,4),(2,4)])

# add graphviz layout options (see /sf/answers/2776346821/)
G.graph['edge'] = {'arrowsize': '0.6', 'splines': 'curved'}
G.graph['graph'] = {'scale': '3'}

# adding attributes to edges in multigraphs is more complicated but see
# /sf/answers/1868591091/                    
G[1][1][0]['color']='red'

A = to_agraph(G) 
A.layout('dot')                                                                 
A.draw('multi.png')   

请注意，您还可以在ipython shell中轻松调用图形：https ://stackoverflow.com/a/14945560